ATAC-seq(转座酶可及性染色质测序)是一种通过高通量测序技术研究基因组中染色质可及性的方法,主要用于揭示调控基因表达的开放染色质区域。其核心是通过转座酶Tn5高效插入测序接头的特性,精准标记并测序可接近的DNA区域,从而帮助解析基因调控机制。以下从技术原理、核心优势、应用场景及操作流程...
ATAC-seq,全称 Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing,是 2013 年由斯坦福大学 William J. Greenleaf 和 Howard Y. Chang 实验室开发的用来研究染色质可及性(通常也理解为染色质的开放性)的方法。 真核生物的核 DNA 并不是裸露的,而是组蛋白与之结合。DNA 一圈一圈地缠绕在...
ATAC-seq全称Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,即利用转座酶研究染色质可进入性的高通量测序技术。 要理解这项技术的作用,首先需要认识染色体的结构。 真核生物的核DNA并不是裸露的,而是有蛋白质即组蛋白与之相结合的。DNA一圈一圈地缠绕在组蛋白上,形成串珠式的...
ATAC-seq,全称Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing,ATAC-Seq方法由斯坦福大学的Howard Chang和William Greenleaf实验室的首席研究员Jason Buenrostro于2013年在《Nature Methods》杂志上首次发表。 ATAC-seq原理: 要理解这项技术的原理,首先要知道染色体/质的结构。真核生物的核DNA并...
ATAC-seq,全称Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughout sequencing,即转座酶可接近染色质测序,是一种创新的表观遗传学研究技术。ATAC-seq的核心技术酶--转座酶Tn5可以把DNA序列进行随机打断,将测序接头直接插入到开放...
单细胞ATAC-seq技术,顾名思义就是在单细胞水平上的ATAC-seq技术,它兼具单细胞技术的高分辨率及ATAC-seq的优势,是目前研究基因表观组学的热门技术。ATAC-seq的全称是Assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,是基于高通量测序对开放性染色质(open chromatin)进行研究的技术。
单细胞ATAC-seq技术,顾名思义就是在单细胞水平上的ATAC-seq技术,它兼具单细胞技术的高分辨率及ATAC-seq的优势,是目前研究基因表观组学的热门技术。ATAC-seq的全称是Assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,是基于高通量测序对开放性染色质(open chromatin)进行研究的技术。
ATAC-seq 全称是 Assay for Transposase-Accessible Chromatin sequencing 即借助Tn5转座酶对开放染色质区域进行高通量测序. 为了找到开放染色质区,基因组被TN5转座酶处理。在ATAC-Seq中,修饰后的TN5将与NextEra接头相对应的DNA序列插入到基因组的开放区域,同时,DNA被转座酶的活性剪切 对于染色质可及性的检测方法一开始...
ATAC-seq,英文全称Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing,中文可理解为结合高通量测序技术的靶向开放染色质的研究方法。这个方法是2013年由斯坦福大学的William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室共同开发的用于研究染色质可及性/开放性的方法。目前,通过ATAC-seq方法发表的文章数量...