ATAC-seq,英文全称Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing,中文可理解为结合高通量测序技术的靶向开放染色质的研究方法。这个方法是2013年由斯坦福大学的William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室共同开发的用于研究染色质可及性/开放性的方法。目前,通过ATAC-seq方法发表的文章数量...
ATACseq基因检测的英文全称是assay for transposase-accessible chromatin using sequencing,简称为ATACseq.这主要是一种在基因解码过程中用来了解部分基因序列的检测方法。 ATACseq应用案例: 这是一种快速和敏感的替代DHS定位的方法,DHS定位法需要5000到50000个细胞,使软骨和其他主要关节组织的分析成为可能。在一个具体的...
ATAC-seq ,英文全称Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing。用于研究染色质可及性/开放性的方法。一、什么是染色质可接近性/开放性？DNA与组蛋白结合后形成核小体，核小体再进一步折叠压缩后最终形成染色质。DNA的复制和转录都需要 将染色质紧密结构打开 ，从而 允许调...
什么是ATAC-seq?它和Chip-seq有什么区别?ATAC-seq,全称Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughp… 阅读全文 赞同 添加评论 分享 收藏 【文献解读】ATF3通过重构染色质可及性图谱来驱动衰老 京房生物 ChIP、ATAC、RIP、MeRIP、MeDIP等表观组学 ...
根据ATAC-seq peaks和所有样本中的基因表达的相关性建立模型进行预测 7. Validation and utility of predicted links between distal elements and genes 采用了CRISPR干扰策略验证预测的 peak-to-gene links。针对预测的peak-to-gene links的非峰值区域,预计将导致位于几十到数百基因的连接基因表达减少。在全基因组范...
ATAC-seq,英文全称Assay for Targeting Accessible-Chromatin with high-throughout sequencing,中文可理解为结合高通量测序技术的靶向开放染色质的研究方法。这个方法是2013年由斯坦福大学的William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室共同开发的用于研究染色质可及性/开放性的方法。目前,通过ATAC-seq方法发表的文章数量...
近年来,一项新的测序技术逐渐融入了大家的视野,那就是ATAC-seq,英文全称 Assay for Transposase – Accessible Chromatin with highthroughput sequencing,它是一种通过使用高通量测序对易接近转座酶核染色质进行分析的一种方法。通过高活性的Tn5转座酶将测序接头插入染色质的开放区域,然后通过测序数据来推断染色质区域的...
ATAC全称如下 Assay for Transposase Accessible Chromatin with hight-throughput sequencing 名字很长,翻译为转座酶可及的染色质区域的高通量测序。在这个冗长的名字中,高通量测序我们一点都不陌生,NGS二代测序已经发展了这么多年,各种组学技术,比如WES, WGS, RNA_seq等等,应用非常广泛。那么”转座酶可及的染色质区域...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing) 是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性(通常也理解为染色质的...