通过ac4C-RIP-seq和ac4C-seq的双重筛选,作者最终得到476个NAT10响应的ac4C靶基因,包含核心多能性调节因子OCT4和SOX2(Figure 7A)。作者利用IGV查看OCT4和SOX2上的ac4C修饰情况,通过对比ac4C-seq检测到的ac4C位点和ac4C-RIP-seq筛选到的ac4C peak,作者发现WT hESC中OCT4上ac4C位点与ac4C peak显著重叠,但NAT10 KD ...
本研究通过RIP-seq鉴定SRSF6调控的可变剪切(AS)及其结合位点,揭示SRSF6在CRC样本中上调,并与不良预后相关,在体外和体内促进增殖和转移。鉴定出SRSF6调控的AS靶标,并揭示SRSF6结合位点。SRSF6通过直接结合到其23号外显子位点来调控ZO-1异常剪接,从而作为癌基因发挥作用。 图:RIP-seq鉴定SRSF6调控的RNA结合motif[7...
前人研究显示,NAT10是现已知RNA ac4C乙酰化修饰唯一调控酶。因此,研究者利用ac4C-RIP-seq技术首次全面系统的揭示了人心肌肥厚组织及小鼠心脏重构模型中的ac4C乙酰化修饰图谱。通过功能富集分析发现两个物种之间存在显著的重叠,其ac4C乙酰化修饰...
随后,研究团队构建了在T细胞特异性敲除Nat10的基因缺陷小鼠(CKO小鼠),发现CKO小鼠外周T细胞数量显著减少,且存在明显的增殖受限及凋亡增加的现象。通过RNA-seq与ac4C-RIP-seq联合分析,研究人员发现NAT10缺失导致T细胞中MycmRNA ac4C修饰水平显...
GenelilyTMac4C RIP试剂盒专为RNA ac4C研究而设计,通过MeRIP方法,可以实现对转录组中ac4C修饰区域的特异性富集。本试剂盒包含了MeRIP流程中的所有核心试剂,如:验证过的ac4C抗体、RNA片段化试剂、蛋白A/G磁珠、IP和洗脱缓冲液等,具有更好的性价比。此外,试剂盒中包含了对照IgG抗体,便于用户进行实验质控,保证了实验的...
ac4c RIP试剂盒GenSeq(R) ac4C RIP试剂盒专为RNA ac4C研究而设计,通过MeRIP方法,可以实现对转录组中ac4C修饰区域的特异性富
因此,研究者利用ac4C-RIP-seq技术首次全面系统的揭示了人心肌肥厚组织及小鼠心脏重构模型中的ac4C乙酰化修饰图谱。通过功能富集分析发现两个物种之间存在显著的重叠,其ac4C乙酰化修饰的转录本主要编码与超分子纤维组织、肌动蛋白丝基础过程和肌肉系统过程相关的蛋白质,并进一步证实了ac4C乙酰化修饰可能通过改变某些关键基因...
G. 通过抗NAT10抗体进行RIP的免疫沉淀Western blot结果:在对照组(siNC)和接头蛋白缺失组(siPCBP1/2和siTDP43)中,检测到NAT10、TDP43、PCBP1和PCBP2的免疫沉淀。当PCBP1/2缺失时,TDP43与NAT10之间的相互作用得以维持。反之亦然。 H. NAT10/PCBP/TDP43复合体在mRNA乙酰化中的示意图:在正常情况下,NAT10/PCB...
G. 通过抗NAT10抗体进行RIP的免疫沉淀Western blot结果:在对照组(siNC)和接头蛋白缺失组(siPCBP1/2和siTDP43)中,检测到NAT10、TDP43、PCBP1和PCBP2的免疫沉淀。当PCBP1/2缺失时,TDP43与NAT10之间的相互作用得以维持。反之亦然。 H. NAT10/PCBP/TDP43复合体在mRNA乙酰化中的示意图:在正常情况下,NAT10/PCB...
因此,研究者利用ac4C-RIP-seq技术首次全面系统的揭示了人心肌肥厚组织及小鼠心脏重构模型中的ac4C乙酰化修饰图谱。通过功能富集分析发现两个物种之间存在显著的重叠,其ac4C乙酰化修饰的转录本主要编码与超分子纤维组织、肌动蛋白丝基础过程和肌肉系统过程相关的蛋白质,并进一步证实了ac4C乙酰化修饰可能通过改变某些关键基因...