单细胞RNA测序技术详解:原理流程与步骤应用 单细胞RNA测序,通常简称为scRNA-seq,是一项革命性的生物技术,已经改变了我们对生命科学的理解方式。这项技术使研究人员能够深入了解单个细胞的基因表达模式,揭示了生物体内的细胞异质性和功能多样性。在本文中,我们将探讨单细胞RNA测序的意义以及它在生物研究中的应用。 一、...
scRNA-seq单细胞测序技术可对分散的单个细胞分别进行基因组、转录组、表观遗传组或多组学测序,可从较少的肿 瘤细胞中获得取可能多的信息。其过程和原理,首先就是给一个bead表面合成无数含有polyT的反转录引物(一个磁珠上含有的polyT引物数量可以高达10的8次方个),然后将每一个磁珠和一个单细胞通过微流控技术放到...
这八个亚型跟scRNA-seq鉴定到的分群结果相吻合,从而确认了Patch-seq方法的有效性。 Patch-seq的分析适用于离子通道和受体基因研究,可以预测神经生理学表型。跟鲜活细胞的scRNA-seq相比,Patch-seq捕获到的基因显然更少,通量相对更低,然而正因为有不同的单细胞测序方法,使得从单细胞尺度上深入分析分子特征、形态和异常...
然而,使用批量RNA-seq,我们只能估计每个基因在细胞群中的平均表达水平,而不考虑该样本中单个细胞之间基因表达的异质性。因此,它不足以研究异质系统,例如早期发育研究或复杂组织,例如大脑。 为了克服这一限制,开发了允许在单细胞水平(scRNA-seq)应用RNA- seq的新协议,并于2009年首次发表(Tang等人,2009)。这项技术从...
组学技术:scRNA-seq 胸主动脉瘤及夹层(TAAD)是一种危及生命的疾病,其特征是胸主动脉内层变性。彻底了解发病过程中调节因子的变化对临床治疗的发展至关重要。为了描述TAAD发展过程中的细胞和分子变化,本研究在从疾病早期到晚期的三个时间点对β-氨基丙腈诱导的TAAD小鼠模型的胸主动脉细胞进行了单细胞RNA测序。进行了...
肿瘤微环境(TME)由异质细胞组成,影响癌细胞行为,从而影响所采用的治疗方法(如免疫疗法)的疗效。单细胞RNA测序可(scRNA-seq)揭示肿瘤微环境的特征,更好地将这些特征与癌症预后联系起来,对制定癌症治疗方案具有指导意义。 scRNA-seq在TME中的重要研究结果[1] ...
近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,非常有利于研究细胞间的表达异质性。目前单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)已经广泛应用于各类物种(特别是人、小鼠等)的不同类型组织和细胞系,包括正常和病变细胞等。自从...
单细胞RNA测序,简称scRNA-seq,是一种让科学家能够研究混合群体中单个细胞中基因表达的技术, 而混合群体是所有细胞在人体组织中的存在的方式。 做为单细胞测序技术大家族的一部分,scRNA-seq涉及捕获单个细胞的RNA,并在多次分子转化反应后,对其进行测序。由于RNA是从DNA基因到蛋白质的中间步骤,它提供了一个关于特定细胞...
| 单细胞转录组测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq),也称为单细胞 RNA 测序,是在单细胞水平对转录组进行测序的一项新的颠覆性技术,是研究单个细胞内基因表达的强有力的工具,可以解决在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的问题,让解析单个细胞的行为、机制及其与...
exo+snRNA-seq是指exosome + single nucleus RNA sequencing(外泌体+单细胞核测序),是借由特殊的样本处理方法,实现在同一份样本中分别纯化和制备组织外泌体和单细胞核悬液,从而达成同时测序同一组织中单细胞转录组及外泌体microRNA的目的。结合欧易生物开发的数据库与