近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,非常有利于研究细胞间的表达异质性。目前单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)已经广泛应用于各类物种(特别是人、小鼠等)的不同类型组织和细胞系,包括正常和病变细胞等。自从20...
drop-seq技术也紧接着在2015年问世,它允许将一个细胞和一个功能珠压缩到油乳剂中的一个液滴中,使得细胞裂解、条形码和反转录可以在单个液滴中完成。第一个便携式单细胞文库生成平台,称为seq-well的单细胞库制备程序也在2017年由Gierahn et al.开发。近几年,scRNA-seq出现了爆发式的发展和普及,技术不断优化和...
总之,单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术是现代生物学研究的重要工具,它使我们能够深入了解单个细胞的基因表达情况,揭示生命的奥秘。随着技术的不断发展和应用的拓展,scRNA-seq技术在细胞生物学、发育生物学、疾病研究和个体化医学等领域将发挥越来越重要的作用,为科学研究和医学进步提供强大支持。 发布于:广东省 平台声...
| 单细胞转录组测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq),也称为单细胞 RNA 测序,是在单细胞水平对转录组进行测序的一项新的颠覆性技术,是研究单个细胞内基因表达的强有力的工具,可以解决在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的问题,让解析单个细胞的行为、机制及其与...
通过scRNA-seq 技术获得 4727 个高质量细胞的转录组数据,并使用 seurat R 包对其进行 PCA 降维分析,利用 t-SNE 算法展示聚类结果。为降低原生质体制备过程对转录组数据造成的影响,作者对原生质体(两个生物学重复)和非原生质体(两个生物学重复)分别进行了常规 bulk RNA-seq ,并使用 DESeq2 进行差异分析。在进行...
通过皮尔森相关性分析显示,scRNA-seq和ST基因表达具有显著的相关性,说明两个样本为来自于同一个部位的两个生物学重复(图3A)。此外作者对单细胞转录组测序数据进行整合分析,通过已知的marker基因确定了15个细胞类型,且在心脏不同位置的细胞类型分布呈现显著多样性(图3B-C)。