单细胞转录组测序(scRNA-seq)是在单细胞水平上研究基因表达差异的技术,为细胞异质性研究提供了有力手段。而单细胞ATAC测序(scATAC-seq)是利用转座酶在单细胞水平上研究染色质开放性的技术,可以提供高分辨率的单细胞染色质开放图谱,有助于深入研究细胞异质性的表观遗传调控机理。它们的研究对象一个是mRNA,一个是染色...
单细胞转录组测序(scRNA-seq)是一种在单细胞水平对转录组进行测序分析的高通量测序技术,能够揭示细胞层面的基因表达差异,为研究细胞的异质性提供了有力手段。而TCR/BCR测序是一种用于分析T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor, BCR)的高通量测序技术,可以揭示T细胞和B细胞受体的多样性和特...
(scRNA-seq)从一枚癌细胞的“基因日记”里挖出了真相——患者A的肿瘤中潜伏着一群“伪装者”:看似人畜无害的成纤维细胞,竟偷偷分泌信号分子,帮癌细胞免疫逃逸。 如果您的研究还停留在“组织样本平均值”,可能已经输在了科研起跑线上。 一、一句话说清技术本质:细胞界的“全员核酸检测” 试想:假设某小区爆...
技术原理 单细胞RNA-seq 技术原理 应用方向 发育生物学、免疫学、神经科学、癌症研究等领域,单个细胞的基因表达特征,揭示细胞异质性、发现新的亚型、研究细胞发育和分化过程、探索细胞类型和功能等。 我们的优势 (1)更先进的平台选择-拥有高捕获效率的10X Genomics和国产单细胞捕获平台; (2)更丰富的技术实力和经验-...
近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,非常有利于研究细胞间的表达异质性。目前单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)已经广泛应用于各类物种(特别是人、小鼠等)
scRNA_seq:单细胞转录组测序简介,欢迎关注”生信修炼手册”!在传统的测序技术中,上机测序的样本是由多个细胞构成的,最后分析得出的结论也只是基于
每个细胞都是独特的,和普通的Bulk RNA-seq不同,材料不容易获得,不太好做重复,因此通过生物学重复来评价技术手段/数据质量的方法不靠谱。 但是数据质量还是需要评价的,那么就通过向每个细胞裂解液中加入已知序列与一定数量的合成mRNA,例如 external RNA control consortium (ERCC)【翻译的话,姑且翻译成:外源RNA对照联盟...
关于单细胞测序,我们已经知道了它和bulk RNA-seq的区别,简单说就是scRNA体现异质性(个体),bulk体现平均程度(总体),因此利用bulk RNA不能区分一个样本中的不同细胞类型 scRNA&bulk RNAseq 做scRNA的最大的好处就是可以"对症下药"(当然这也是最理想的情况=》什么细胞配合什么种类或者剂量的药物) ...
单细胞转录组测序是在单个细胞水平进行高通量转录组测序的一项新技术,能够有效解决细胞异质性以及bulk RNA-seq被掩盖的细胞群内转录组异质性难题,有助于发现新的稀有细胞类型,深入了解细胞生长过程中的表达调控机制。 10x Genomics Chromium系统利用微流控、油包水的微反应体系,通过序列标签(cellbarcode和UMI)区别群体中...
BD RhapsodyTM单细胞捕获其技术原理的关键是利用自然沉降的方法。先让单细胞悬液流过蜂窝板(蜂窝板上有20万+的微孔,数量远大于投入的细胞数量),让细胞落入微孔中。细胞分别落入微孔后,随后在蜂窝板上铺上过量磁珠,确保绝大多数微孔都落入了磁珠;冲洗过量的磁珠后,绝大部分微孔中均含有单个的磁珠,最终在微孔中形成...