Smart-seq SMART(Switching mechanism at 5’ end of the RNA transcript)是一个具有里程碑意义的重要技术。实际上,能够从单细胞生成全长cDNA的测序方案并不多,Smart-seq就是其中之一。对于等位基因特异性表达或者剪接变体研究来说,覆盖整个转录组是一件非常重要的事情。
什么是bulk rna sequencing(3) CEL-seq和其他线性扩增方法生成文库花费的时间要稍微长一点。不过,CEL-seq在早期阶段就给样本贴上条码并进行混合,大大减少了手动操作的时间。PCR是在最后阶段使用的,主要是为了连接正确的测序接头,CEL-seq开发者纽约大学的Itai Yanai介绍到。CEL-seq所需试剂都是现成的,大约两天时间生...
bulkrna-se..Bulk RNA-seq是一种用于大规模RNA测序的技术,通常在生物学研究中使用。它通过一次捕获和提取细胞或组织中所有mRNA的能力来实现其效率和大批量处理能力。这种方法可以提供对基因表达的全面视图,
什么是bulk rna sequencing(2) Fluidigm C1单细胞制备系统能够自动完成Smart-seq步骤。你只需要将制备好的细胞悬液加进去,仪器就会分离并裂解细胞,把mRNA逆转录为cDNA,再对cDNA进行扩增。扩增后的cDNA可以拿来测序,也可以进行qPCR检测。 在Enard的比较研究中,Fluidigm C1系统的Smart-seq最为灵敏,成本也最高。这一系...