什么是bulk rna sequencing(1) 多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制,即使是同类型细胞,基因表达也会出现差异。 那么,细胞之间的哪些差异有生物学意义,哪些差异来自于技术偏好呢?要获得可靠的结果又...
SCRB-seq Broad研究所开发的SCRB-seq(single-cell RNA barcoding and sequencing)技术采用的是PCR扩增。该技术需要结合流式细胞仪(FACS)或者其他细胞分选方法,把单细胞分配到微孔里去。 SCRB-seq与Smart-seq比较相似,只不过SCRB-seq会整合特异性的细胞条码,以分辨扩增分子的来源,更准确的定量转录本。此外,SCRB-seq并...
CEL-seq(Cell expression by linear amplification and sequencing)是一种采用线性扩增的常用测序方法。线性扩增的主要优势是错误率比较低,不过线性扩增和PCR都存在序列依赖性偏好。 CEL-seq技术发表于2012年,主要是分离单细胞,逆转录带有poly-A 尾巴的mRNA片段,给它们贴上代表其细胞来源的条码。2014年Science杂志发布的...