p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
R语言中,ggplot2可以用来绘制直观的小提琴图(violin plot),便于理解数据分布和差异。首先,确保数据中'surstat'列为factor类型,便于分析。1. 单个“两组”图绘制 以gene39为例,可以先尝试默认参数绘制,然后根据需要调整美观,如添加p值。利用ggpubr包可方便地插入p值,并用星号形式表示。 2....
install.packages("ggplot2") 1. 然后,加载ggplot2包: library(ggplot2) 1. 2. 数据准备 假设我们有一个名为data的数据框,其中包含两列:category和value。category表示分组,value表示数值。 data<-data.frame(category=c("A","B","A","B","A","B"),value=c(10,20,15,25,12,18)) 1. 2. 3. ...
在R语言中使用ggpubr包绘制小提琴图时,分面的调整可以通过以下方式进行:默认布局:三个图形:默认排列成一排。四个图形:默认调整为2行2列的布局。自定义布局:若需自定义图形的行列布局,可利用facet_wrap函数。例如,实现一排四图的布局或一列四行的布局,需在facet_wrap函数中指定相应的参数。例如...
Basic violin plot Building a violin plot with ggplot2 is pretty straightforward thanks to the dedicated geom_violin() function. # Library library(ggplot2) # create a dataset data <- data.frame( name=c( rep("A",500), rep("B",500), rep("B",500), rep("C",20), rep('D', 100...
get_data<-function(){data("ToothGrowth")ToothGrowth$dose<-as.factor(ToothGrowth$dose)return(ToothGrowth)}# 数据集 # @len 目标变量, 为连续变量 # @ dose 分组变量,需要转换为因子 # @ supp 分组变量,需要转换为因子 ToothGrowth<-get_data()# 需要的包library(ggplot2)library(patchwork)library(tidyverse...
使用ggplot创建多个堆叠的小提琴图。 rggplot2violin-plot 4 我有一个模型在不同景观上运行,一次同时在两个上运行,一次分别在每个上运行。我想要用小提琴图来绘制结果,但我想要在同一个图中将这两次运行并排而列,并且每个景观都有自己的小提琴(因此是2个堆栈中的4个小提琴)。示例数据: df1 <- data.frame(...
library(ggplot2)# Basic violin plotp<-ggplot(ToothGrowth,aes(x=dose,y=len))+geom_violin()p# Rotate the violin plotp+coord_flip()# Set trim argument to FALSEggplot(ToothGrowth,aes(x=dose,y=len))+geom_violin(trim=FALSE) Note that by defaulttrim = TRUE. In this case, the ta...
Create a violin plot with error bars. Violin plots are similar to box plots, except that they also show the kernel probability density of the data at different values.ggviolin( data, x, y, combine = FALSE, merge = FALSE, color = "black", fill = "white", palette = NULL, alpha = ...
关于plot:R split violinplot ggplot2 R split violinplot ggplot2 我正在尝试用ggplot2制作拆分小提琴情节,就像这样。我找到了一个非常好的代码,但我无法使用它,因为当我尝试创建pdat时它是空的,我不知道为什么会这样。接下来我附上了我的数据摘要和我正在做的事情,以及结果。谁能帮帮我?