p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
流程跟前文ggplot2绘制差不多 4.1 先直接绘图: p <- ggviolin(data, x = "Stage", y = "gene39", fill = "Stage", alpha = 1, width = 0.5, ylab="Normalized Expression", xlab="Stage", add = "boxplot", add.params = list(fill = "white", width = 0.1,linetype = 1)) 这里还是以g...
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+geom_violin(aes(fill=cell.type),show.legend=F)+theme(panel.grid=element_blank(),panel.background=element_blank(),axis.line=element_line(),axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0.5),plot.title=element_text(hjust=0.5))+labs(x=NULL,y...
library(ggplot2)plot3<-ggplot(violin2,aes(x=V2,y=V1))+geom_violin()plot3 image.png 在此基础上加一个表示平均值的点 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 plot3+stat_summary(fun=mean,geom="point",shape=23,size=2) image.png 在这个基础上再添加抖动的散点图 代码语言:javascrip...
R语言使用ggplot2绘制两个组不同时期小提琴图 引言 在数据可视化中,小提琴图(violin plot)是一种常用的图表类型,用于比较两个或多个组的分布情况。它可以展示数据的分布形状、中位数、四分位数等统计量,帮助我们分析不同组之间的差异。本文将介绍如何使用R语言的ggplot2包绘制两个组在不同时期的小提琴图。
R语言中使用ggplot2包绘制分组小提琴图(violin plot) 作为一名刚入行的开发者,你可能对R语言中的ggplot2包绘制分组小提琴图感到困惑。不用担心,接下来我将一步步教你如何实现这一功能。 1. 准备工作 首先,确保你的R环境中已经安装了ggplot2包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装: ...
2.3、小提琴图绘制在本次案例中，我们采用了ggplot2包中的geom_violin()函数来绘制小提琴图。该函数的使用方法与代码为：geom_violin(mapping = aes(), data = NULL, stat = "ydensity", position = "dodge", ...)其中，mapping参数由aes()函数创建，用于指定数据的映射关系；data参数指定要绘制的数据，...
p1 <- ggplot(df, aes(x=samples, y=values, fill=samples)) + geom_violin() p1 002、增加箱线图 p2<-p1+geom_boxplot(alpha=1,outlier.size=0, size=0.3, width=0.2,fill="white")+stat_summary(fun="mean",geom="point",shape=21, size=2,fill="blue") ...
未安装“ggplot2”等R包的同学请先通过install.packages("包的名字")自行安装。 Step 1:构造模拟数据 首先我们用runif函数构造了5组模拟数据,每组10个随机数。runif函数可以生成指定范围内的均匀分布随机数。 library(tidyverse) library(ggpubr) library(ggsignif) ...
- 类似于ggplot2，我们可以直接在图表上显示p值。- 我们也可以移除图例或调整其位置，以便更好地展示我们的数据。4. 组合多个小提琴图：- 首先独立创建每个图表，然后使用`ggarrange()`函数进行组合。- 这允许我们根据需要自定义布局和美化图表。5. 在单一图表中绘制多个小提琴图：- 我们需要将数据转换...