p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=
流程跟前文ggplot2绘制差不多 4.1 先直接绘图: p <- ggviolin(data, x = "Stage", y = "gene39", fill = "Stage", alpha = 1, width = 0.5, ylab="Normalized Expression", xlab="Stage", add = "boxplot", add.params = list(fill = "white", width = 0.1,linetype = 1)) 这里还是以g...
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+geom_violin(aes(fill=cell.type),show.legend=F)+theme(panel.grid=element_blank(),panel.background=element_blank(),axis.line=element_line(),axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0.5),plot.title=element_text(hjust=0.5))+labs(x=NULL,y...
绘制方法:使用ggplot2包的geom_violin()函数绘制小提琴图,为了更好地表征数据分布,再用geom_boxplot()函数叠加一个箱线图。 绘图操作:使用科研猫提供的提琴图·R代码,只要提供几个参数即可: (1)设置用来绘图的数据文件; (2)设置小提琴的颜色,可以是red、blue、green等各种颜色,当你想绘制多种颜色时,使用“ran...
R语言中使用ggplot2包绘制分组小提琴图(violin plot) 作为一名刚入行的开发者,你可能对R语言中的ggplot2包绘制分组小提琴图感到困惑。不用担心,接下来我将一步步教你如何实现这一功能。 1. 准备工作 首先,确保你的R环境中已经安装了ggplot2包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装: ...
R语言中，ggplot2可以用来绘制直观的小提琴图（violin plot），便于理解数据分布和差异。首先，确保数据中'surstat'列为factor类型，便于分析。1. 单个“两组”图绘制 以gene39为例，可以先尝试默认参数绘制，然后根据需要调整美观，如添加p值。利用ggpubr包可方便地插入p值，并用星号形式表示。 2....
R语言使用ggplot2绘制两个组不同时期小提琴图 引言 在数据可视化中,小提琴图(violin plot)是一种常用的图表类型,用于比较两个或多个组的分布情况。它可以展示数据的分布形状、中位数、四分位数等统计量,帮助我们分析不同组之间的差异。本文将介绍如何使用R语言的ggplot2包绘制两个组在不同时期的小提琴图。
语法:plot + coord_flip() 这里是使用 coord_flip() 函数制作的水平小提琴图。 R实现 # load library ggplot2 library(ggplot2) # Horizontal violin plot # diamonds dataframe has been used here # diamonds dataframe is provided by R language natively. ...
未安装“ggplot2”等R包的同学请先通过install.packages("包的名字")自行安装。 Step 1:构造模拟数据 首先我们用runif函数构造了5组模拟数据,每组10个随机数。runif函数可以生成指定范围内的均匀分布随机数。 library(tidyverse) library(ggpubr) library(ggsignif) ...
2.3、小提琴图绘制在本次案例中，我们采用了ggplot2包中的geom_violin()函数来绘制小提琴图。该函数的使用方法与代码为：geom_violin(mapping = aes(), data = NULL, stat = "ydensity", position = "dodge", ...)其中，mapping参数由aes()函数创建，用于指定数据的映射关系；data参数指定要绘制的数据，...