p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
我们直接通过plot()语句将总体数据进行绘图 plot(data) 可得到所有变量间双变量散点图矩阵 我们通过melt函数将“长数据”转换为“短数据”。 data2<- melt(data) 并对“熔化”后数据直接绘图: plot(data2) 可得到分组的箱型图 通过geom_jitter可绘制出抖点图: ggplot(data2,aes(x=variable,y=value ,fill ...
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+geom_violin(aes(fill=cell.type),show.legend=F)+theme(panel.grid=element_blank(),panel.background=element_blank(),axis.line=element_line(),axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0.5),plot.title=element_text(hjust=0.5))+labs(x=NULL,y...
ggplot(data=dfToPlot,aes(x=RELATIONSHIP.0, y=BC_Spec, color=RELATIONSHIP.0))+ geom_violin() 三个图拼图 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 library(ggplot2) ggplot(data=dfToPlot,aes(x=RELATIONSHIP.0, y=BC_Spec, color=RELATIONSHIP.0))+ geom_boxplot() -> p1 p1 ggpl...
R语言中,ggplot2可以用来绘制直观的小提琴图(violin plot),便于理解数据分布和差异。首先,确保数据中'surstat'列为factor类型,便于分析。1. 单个“两组”图绘制 以gene39为例,可以先尝试默认参数绘制,然后根据需要调整美观,如添加p值。利用ggpubr包可方便地插入p值,并用星号形式表示。 2....
未安装“ggplot2”等R包的同学请先通过install.packages("包的名字")自行安装。 Step 1:构造模拟数据 首先我们用runif函数构造了5组模拟数据,每组10个随机数。runif函数可以生成指定范围内的均匀分布随机数。 library(tidyverse) library(ggpubr) library(ggsignif) ...
R语言使用ggplot2绘制两个组不同时期小提琴图 引言 在数据可视化中,小提琴图(violin plot)是一种常用的图表类型,用于比较两个或多个组的分布情况。它可以展示数据的分布形状、中位数、四分位数等统计量,帮助我们分析不同组之间的差异。本文将介绍如何使用R语言的ggplot2包绘制两个组在不同时期的小提琴图。
重点内容: 使用facet_wrap函数自定义分面布局。 通过调整ncol和nrow参数来控制行列数。 创建比较列表变量以添加组间比较连接线。以上内容提供了在R语言中使用ggpubr包绘制小提琴图时分面调整的基本方法和步骤。如需深入了解,可查阅相关博客文章或学习资料,如“ggplot2学习笔记10:分面详解”。
demo数据可以在https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/demoData/BoxPlot/boxplot.txt下载。 包含2个维度的数据,通常每一列是个样本,每一行是个基因 3. R语言怎么画小提琴图 # 加载R包,没有安装请先安装 install.packages("包名") library(ggplot2) ...
1. 玩转数据可视化之R语言ggplot2:(三)ggplot2实现将多张图放在一起,包括并排和插图绘制(快速入门)(8837) 2. 玩转数据可视化之R语言ggplot2:(七)对图形添加注释和标签(包含标题、坐标轴、参考线和高亮等注释方法)(3713) 3. 玩转数据可视化之R语言ggplot2:(八)ggplot2绘制空间地理数据图(2102) 4. 【R...