p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
流程跟前文ggplot2绘制差不多 4.1 先直接绘图: p <- ggviolin(data, x = "Stage", y = "gene39", fill = "Stage", alpha = 1, width = 0.5, ylab="Normalized Expression", xlab="Stage", add = "boxplot", add.params = list(fill = "white", width = 0.1,linetype = 1)) 这里还是以g...
p <- ggplot()+ #核密度图: geom_violin(data=data_long,aes(group, Score, color = group, fill = group), width = 0.75)+ # 箱线图: geom_boxplot(data=data_long,aes(group, Score, color = group), width = 0.2)+ # 抖动散点: geom_jitter(data=data_long,aes(group, Score, color = ...
R语言中使用ggplot2包绘制分组小提琴图(violin plot) 作为一名刚入行的开发者,你可能对R语言中的ggplot2包绘制分组小提琴图感到困惑。不用担心,接下来我将一步步教你如何实现这一功能。 1. 准备工作 首先,确保你的R环境中已经安装了ggplot2包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装: install.packages("ggplot2...
p<-ggplot(data, aes(x = dose, y = len))#注释:”x=”,”y=”表示x轴和y轴表示的变量数值,p表示图像对象 p+geom_violin()#注释:画出violin plot的函数Step5.美化 p+geom_violin(aes(fill = dose))#注释:按组别填充不同的颜色 *如果你想手动改变颜色,可以使用这一句 ...
library(ggplot2)library(reshape2)# 注释:package使用之前需要调用 Step4. 绘图 代码语言:javascript 复制 data_melt<-melt(data)ggplot(data_melt,aes(x=variable,y=value,fill=variable))+geom_violin(alpha=0.5,aes(linetype=NA))+geom_jitter(shape=21,aes(fill=variable),position=position_jitter(width=0....
R语言中，ggplot2可以用来绘制直观的小提琴图（violin plot），便于理解数据分布和差异。首先，确保数据中'surstat'列为factor类型，便于分析。1. 单个“两组”图绘制 以gene39为例，可以先尝试默认参数绘制，然后根据需要调整美观，如添加p值。利用ggpubr包可方便地插入p值，并用星号形式表示。 2....
参考代码来自于:Violin plot with ggstatsplot – the R Graph Gallery (r-graph-gallery.com) 大家可以一起共同学习 此次用的包是ggstatsplot install.packages(c("ggstatsplot","palmerpenguins","tidyverse"))library(ggstatsplot)library(palmerpenguins)library(tidyverse)library(rstantools)#上传数据getwd()y...
使用R语言的ggpubr包绘制小提琴图（violin plot）的步骤与技巧介绍。1. 使用ggviolin命令绘制单个两分组的小提琴图，可通过添加命令更改配图颜色，选择杂志风格如 "npg"、"aaas" 等。1.1 更改横坐标两个分组的名字，但上方的图例名字无法直接更改。可先在数据中进行修改。1.2 添加p值与ggplot2绘图...
p <- ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_violin(trim=FALSE) p + stat_summary(fun.data=mean_sdl, mult=2, geom="pointrange", color="red") 2.3 添加散点 代码语言:text 复制 #带点小提琴图 p + geom_dotplot(binaxis='y', stackdir='center', dotsize=1) ...