p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
流程跟前文ggplot2绘制差不多 4.1 先直接绘图: p <- ggviolin(data, x = "Stage", y = "gene39", fill = "Stage", alpha = 1, width = 0.5, ylab="Normalized Expression", xlab="Stage", add = "boxplot", add.params = list(fill = "white", width = 0.1,linetype = 1)) 这里还是以g...
在R语言中,使用ggplot2包绘制小提琴图(Violin Plot)是一个常见的数据可视化任务。小提琴图结合了箱线图和密度图的特征,主要用于展示数据的分布形状。以下是绘制小提琴图的详细步骤,包括加载必要的库、准备数据、创建基本图形、添加小提琴图层以及添加其他图层等。 1. 加载ggplot2库 在R中绘制小提琴图之前,首先需要...
p <- ggplot()+ #核密度图: geom_violin(data=data_long,aes(group, Score, color = group, fill = group), width = 0.75)+ # 箱线图: geom_boxplot(data=data_long,aes(group, Score, color = group), width = 0.2)+ # 抖动散点: geom_jitter(data=data_long,aes(group, Score, color = ...
绘制方法:使用ggplot2包的geom_violin()函数绘制小提琴图,为了更好地表征数据分布,再用geom_boxplot()函数叠加一个箱线图。 绘图操作:使用科研猫提供的提琴图·R代码,只要提供几个参数即可: (1)设置用来绘图的数据文件; (2)设置小提琴的颜色,可以是red、blue、green等各种颜色,当你想绘制多种颜色时,使用“ran...
重点内容： 使用facet_wrap函数自定义分面布局。 通过调整ncol和nrow参数来控制行列数。 创建比较列表变量以添加组间比较连接线。以上内容提供了在R语言中使用ggpubr包绘制小提琴图时分面调整的基本方法和步骤。如需深入了解，可查阅相关博客文章或学习资料，如“ggplot2学习笔记10：分面详解”。
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+geom_violin(aes(fill=cell.type),show.legend=F)+theme(panel.grid=element_blank(),panel.background=element_blank(),axis.line=element_line(),axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0.5),plot.title=element_text(hjust=0.5))+labs(x=NULL,...
R语言中，ggplot2可以用来绘制直观的小提琴图（violin plot），便于理解数据分布和差异。首先，确保数据中'surstat'列为factor类型，便于分析。1. 单个“两组”图绘制 以gene39为例，可以先尝试默认参数绘制，然后根据需要调整美观，如添加p值。利用ggpubr包可方便地插入p值，并用星号形式表示。 2....
在数据可视化中,小提琴图(Violin Plot)是一种很有用的工具,可以展示数据的分布及其密度。本文将指导初学者如何在R中绘制一个按大小顺序的小提琴图。以下是实现这一目标的步骤流程。 实现步骤流程 步骤详解 1. 导入所需的库 首先,我们需要安装并加载相关的R包ggplot2用于绘图。
# 把数据转换成ggplot常用的类型(长数据) df = df %>% pivot_longer(-1,names_to = "Sample",values_to = "Value") # 绘图 p = ggplot(df,aes(x=Sample,y=Value,fill=Sample))+ # stat_boxplot(geom = "errorbar", # 添加误差线 # width=0.3)+ geom_violin(alpha = 1, # 透明度 trim =...