流程跟前文ggplot2绘制差不多 4.1 先直接绘图: p <- ggviolin(data, x = "Stage", y = "gene39", fill = "Stage", alpha = 1, width = 0.5, ylab="Normalized Expression", xlab="Stage", add = "boxplot", add.params = list(fill = "white", width = 0.1,linetype = 1)) 这里还是以g...
p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
p <- ggplot()+ #核密度图: geom_violin(data=data_long,aes(group, Score, color = group, fill = group), width = 0.75)+ # 箱线图: geom_boxplot(data=data_long,aes(group, Score, color = group), width = 0.2)+ # 抖动散点: geom_jitter(data=data_long,aes(group, Score, color = ...
p <- ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_violin(trim=FALSE) p + stat_summary(fun.data=mean_sdl, mult=2, geom="pointrange", color="red") 2.3 添加散点 代码语言:text 复制 #带点小提琴图 p + geom_dotplot(binaxis='y', stackdir='center', dotsize=1) #点发散 p + g...
p1 <- ggplot(df, aes(x=samples, y=values, fill=samples)) + geom_violin() p1 002、增加箱线图 p2<-p1+geom_boxplot(alpha=1,outlier.size=0, size=0.3, width=0.2,fill="white")+stat_summary(fun="mean",geom="point",shape=21, size=2,fill="blue") ...
小提琴图 (Violin Plot) 用于显示数据分布及其概率密度的组合图,结合了箱形图和密度图的特征,主要用来显示数据的分布形状。 对于小提琴的绘制在R中用ggplot2比较常见,也非常简单,下面简单演示如何用R绘制小提琴图,首先我们定义一个演示数据结构: library(ggplot2) ...
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+geom_violin(aes(fill=cell.type),show.legend=F)+theme(panel.grid=element_blank(),panel.background=element_blank(),axis.line=element_line(),axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0.5),plot.title=element_text(hjust=0.5))+labs(x=NULL,...
R语言中使用ggplot2包绘制分组小提琴图(violin plot) 作为一名刚入行的开发者,你可能对R语言中的ggplot2包绘制分组小提琴图感到困惑。不用担心,接下来我将一步步教你如何实现这一功能。 1. 准备工作 首先,确保你的R环境中已经安装了ggplot2包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装: ...
# 创建一个函数,用于生成小提琴图create_violinplot<-function(col_name){# 创建小提琴图violin_plot<-ggplot(exp,aes_string(x="Group",y=col_name,fill="Group"))+geom_violin(scale="width",alpha=0.8,width=0.5,size=0.8)+scale_fill_manual(values=c("#202850","#861B20"))+#geom_jitter(width...
p <- ggplot()+ #核密度图: geom_violin(data=data_long,aes(group, Score, color = group, fill = group), width = 0.75)+ # 箱线图: geom_boxplot(data=data_long,aes(group, Score, color = group), width = 0.2)+ # 抖动散点: ...