p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
流程跟前文ggplot2绘制差不多 4.1 先直接绘图: p <- ggviolin(data, x = "Stage", y = "gene39", fill = "Stage", alpha = 1, width = 0.5, ylab="Normalized Expression", xlab="Stage", add = "boxplot", add.params = list(fill = "white", width = 0.1,linetype = 1)) 这里还是以g...
在R语言中,使用ggplot2包绘制小提琴图(Violin Plot)是一个常见的数据可视化任务。小提琴图结合了箱线图和密度图的特征,主要用于展示数据的分布形状。以下是绘制小提琴图的详细步骤,包括加载必要的库、准备数据、创建基本图形、添加小提琴图层以及添加其他图层等。 1. 加载ggplot2库 在R中绘制小提琴图之前,首先需要...
如下图所示,其外围的曲线宽度代表数据点分布的密度,中间的箱线图则和普通箱线图表征的意义是一样的,代表着中位数、上下分位数、极差等。 绘制方法:使用ggplot2包的geom_violin()函数绘制小提琴图,为了更好地表征数据分布,再用geom_boxplot()函数叠加一个箱线图。 绘图操作:使用科研猫提供的提琴图·R代码,只...
p <- ggplot()+ #核密度图: geom_violin(data=data_long,aes(group, Score, color = group, fill = group), width = 0.75)+ # 箱线图: geom_boxplot(data=data_long,aes(group, Score, color = group), width = 0.2)+ # 抖动散点: ...
R语言中使用ggplot2包绘制分组小提琴图(violin plot) 作为一名刚入行的开发者,你可能对R语言中的ggplot2包绘制分组小提琴图感到困惑。不用担心,接下来我将一步步教你如何实现这一功能。 1. 准备工作 首先,确保你的R环境中已经安装了ggplot2包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装: ...
ggplot(df,aes(x=cell.type,y=Complexity))+geom_violin(aes(fill=cell.type),show.legend=F)+theme(panel.grid=element_blank(),panel.background=element_blank(),axis.line=element_line(),axis.text.x=element_text(angle=90,hjust=1,vjust=0.5),plot.title=element_text(hjust=0.5))+labs(x=NULL,...
ggplot(diamonds,aes(x=cut,y=price))+ # geom_violin() function is used to plow violin plot geom_violin()+ # coord_flip() function is used to make horizontal # violin plot coord_flip() 输出: 均值标记自定义 在ggplot2 中,我们使用 stat_summary() 函数来计算新的汇总统计数据并将其添加到绘...
- 类似于ggplot2，我们可以直接在图表上显示p值。- 我们也可以移除图例或调整其位置，以便更好地展示我们的数据。4. 组合多个小提琴图：- 首先独立创建每个图表，然后使用`ggarrange()`函数进行组合。- 这允许我们根据需要自定义布局和美化图表。5. 在单一图表中绘制多个小提琴图：- 我们需要将数据转换...
r语言两个组不同时期小提琴图ggplot2 R语言使用ggplot2绘制两个组不同时期小提琴图 引言 在数据可视化中,小提琴图(violin plot)是一种常用的图表类型,用于比较两个或多个组的分布情况。它可以展示数据的分布形状、中位数、四分位数等统计量,帮助我们分析不同组之间的差异。本文将介绍如何使用R语言的ggplot2包...