geom_violin(trim=FALSE,color="white") + geom_boxplot(width=0.2,position=position_dodge(0.9))+ theme_bw()+ theme(legend.position = "none") + theme(axis.text.x=element_text(colour="black",family="Times",size=15),#x轴刻度字体 axis.text.y=element_text(family="Times",size=12,face="p...
ggplot(data,aes(x=Exp,y=value))+ geom_violin(width =0.8,fill='grey90',color='grey90')+ geom_quasirandom(aes(color=variable),width = 0.2,size=2)+ #width控制蜂群点宽度 scale_color_manual(name = 'Rep.', values = c('#FFCE99','#FEA6A6','#B4AC94'), labels = c('1','2','...
比如生信菜鸟团的Violin plot 美化 生信星球的大漂亮版本的单细胞小提琴图 以及生信补给站的scRNA分析| Seurat堆叠小提琴图不满足?那就ggplot2 堆叠 各种元素 小结 这期使用VlnPlot函数的相关参数,绘制堆叠小提琴图,以及对小提琴图进行了分组分半的展示 基于ggplot2在VlnPlot结果的基础上进行调整,如果想提取需要的数据...
(data=dfToPlot,aes(x=RELATIONSHIP.0, y=BC_Spec, color=RELATIONSHIP.0))+ geom_jitter() -> p2 p2 ggplot(data=dfToPlot,aes(x=RELATIONSHIP.0, y=BC_Spec, color=RELATIONSHIP.0))+ geom_violin() -> p3 p3 library(patchwork) p1+p2+p3+ plot_layout(guides = "collect") cbPalette <- c...
• Key function: geom_violin()• Alternative function: stat_ydensity()• Key arguments to customize the plot: alpha, color, linetype, size and fill.#基础e+ geom_violin()#旋转e+ geom_violin() + coord_flip()#不修剪小提琴的尾部e+ geom_violin(trim = FALSE, fill = "steelblue")加...
split.plot = T) 将分组以及分组且分半小提琴图拼图,可以更加直观的看到两个分组之间基因表达的差异 使用ggplot2进行美化 因为VlnPlot是一个ggplot的对象,所以可以基于ggplot2进行美化。或者提取需要的数据,使用ggplot2直接绘制小提琴图 1. 美化VlnPlot结果
R语言小提琴图(Violin Plot)及其绘制方法 在数据可视化中,箱线图是用来展示数据分布和离散程度的一种常用图表,它包含了中位数、上下四分位数和异常值等信息。然而,在某些情况下,箱线图可能无法充分展示数据的累积分布情况,无法揭示数据分布的更多细节。为了解决这个问题,小提琴图(Violin Plot)被提出并广泛应用。
• geom_boxplot() for box plot• geom_violin() for violin plot• geom_dotplot() for dot plot• geom_jitter() for stripchart• geom_line() for line plot• geom_bar() for bar plot 今天我们介绍一下如何添加bar 先建立一个数据 library(tidyverse)# ToothGrowth data setdf <- ...
p1 + geom_boxplot() 1. 2. 3. 4. 5. 注意:不同的几何对象,要求的属性会有些不同,这些属性也可以在几何对象映射时提供,以下语法与上面的aes中是一样的。 AI检测代码解析 #结果与上述一致 ggplot(data = diamond)+geom_point(aes(x=carat, y=price, colour=color)) ...
ggplot(mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) + geom_point(shape = 18, color = "steelblue", size = 4)fill可改变填充色，只适用于形状是21-25 ggplot(mtcars, aes(x = wt, y = mpg)) + geom_point(shape = 23, fill = "blue", color = "darkred", size = 3)添加分组元素（默认 ...