流程跟前文ggplot2绘制差不多 4.1 先直接绘图: p <- ggviolin(data, x = "Stage", y = "gene39", fill = "Stage", alpha = 1, width = 0.5, ylab="Normalized Expression", xlab="Stage", add = "boxplot", add.params = list(fill = "white", width = 0.1,linetype = 1)) 这里还是以g...
p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
24种R语言新手入门之小提琴图(三) 数据分析 柱状图和箱线图的代码能理解了其实发现好多作图都是可以触类旁通的,小提琴图作为科研结果常用展示图也不可或缺,用ggplot或者vioplot。 生信初学者 2023/03/14 2K0 R语言ggplot2每周一图活动第五周:箱线图、小提琴图 ggplot2imagepng 在之前提到的tidytuesday里没有找...
下面,小猿团队的小狐带您一步步使用R语言的ggplot函数或统计猿在线工具实现Kruskal-Wallis秩和检验及数据的可视化。本讲内容包括数据准备与整理、Kruskal-Wallis秩和检验和事后多重比较检验。 在学习教程之前,请同学们自行完成R语言GUI和RStudio两个软件的安装。 未安装“ggplot2”等R包的同学请先通过install.packages("...
R语言中使用ggplot2包绘制分组小提琴图(violin plot) 作为一名刚入行的开发者,你可能对R语言中的ggplot2包绘制分组小提琴图感到困惑。不用担心,接下来我将一步步教你如何实现这一功能。 1. 准备工作 首先,确保你的R环境中已经安装了ggplot2包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装: ...
- 类似于ggplot2，我们可以直接在图表上显示p值。- 我们也可以移除图例或调整其位置，以便更好地展示我们的数据。4. 组合多个小提琴图：- 首先独立创建每个图表，然后使用`ggarrange()`函数进行组合。- 这允许我们根据需要自定义布局和美化图表。5. 在单一图表中绘制多个小提琴图：- 我们需要将数据转换...
使用R语言的ggpubr包绘制小提琴图（violin plot）的步骤与技巧介绍。1. 使用ggviolin命令绘制单个两分组的小提琴图，可通过添加命令更改配图颜色，选择杂志风格如 "npg"、"aaas" 等。1.1 更改横坐标两个分组的名字，但上方的图例名字无法直接更改。可先在数据中进行修改。1.2 添加p值与ggplot2绘图...
使用ggplot创建多个堆叠的小提琴图。 rggplot2violin-plot 4 我有一个模型在不同景观上运行,一次同时在两个上运行,一次分别在每个上运行。我想要用小提琴图来绘制结果,但我想要在同一个图中将这两次运行并排而列,并且每个景观都有自己的小提琴(因此是2个堆栈中的4个小提琴)。示例数据: df1 <- data.frame(...
Allowed values include ggplot2 official themes: theme_gray(), theme_bw(), theme_minimal(), theme_classic(), theme_void(), ... ... other arguments to be passed to geom_violin, ggpar and facet.Details The plot can be easily customized using the function ggpar(). Read ?ggpar for cha...
method = "t.test", label = "p.signif", label.x.npc ="left", size = 5) p + facet_wrap(~variable,nrow = 1) 图5 分面调整可参考下面这个文章: ggplot2学习笔记10:分面(Facetting)详解_灯bupa冷的博客-CSDN博客 本文同时发布于微信公众号“无知小生”...