流程跟前文ggplot2绘制差不多 4.1 先直接绘图: p <- ggviolin(data, x = "Stage", y = "gene39", fill = "Stage", alpha = 1, width = 0.5, ylab="Normalized Expression", xlab="Stage", add = "boxplot", add.params = list(fill = "white", width = 0.1,linetype = 1)) 这里还是以g...
p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
下面,小猿团队的小狐带您一步步使用R语言的ggplot函数或统计猿在线工具实现Kruskal-Wallis秩和检验及数据的可视化。本讲内容包括数据准备与整理、Kruskal-Wallis秩和检验和事后多重比较检验。 在学习教程之前,请同学们自行完成R语言GUI和RStudio两个软件的安装。 未安装“ggplot2”等R包的同学请先通过install.packages("...
在R语言中使用ggpubr包绘制小提琴图时，分面的调整可以通过以下方式进行：默认布局：三个图形：默认排列成一排。四个图形：默认调整为2行2列的布局。自定义布局：若需自定义图形的行列布局，可利用facet_wrap函数。例如，实现一排四图的布局或一列四行的布局，需在facet_wrap函数中指定相应的参数。例如...
R语言中，ggplot2可以用来绘制直观的小提琴图（violin plot），便于理解数据分布和差异。首先，确保数据中'surstat'列为factor类型，便于分析。1. 单个“两组”图绘制 以gene39为例，可以先尝试默认参数绘制，然后根据需要调整美观，如添加p值。利用ggpubr包可方便地插入p值，并用星号形式表示。 2....
p<-ggplot(data, aes(x = dose, y = len)) #注释:”x=”,”y=”表示x轴和y轴表示的变量数值,p表示图像对象 p+geom_violin() #注释:画出violin plot的函数 Step5.美化 p+geom_violin(aes(fill = dose)) #注释:按组别填充不同的颜色
R语言中使用ggplot2包绘制分组小提琴图(violin plot) 作为一名刚入行的开发者,你可能对R语言中的ggplot2包绘制分组小提琴图感到困惑。不用担心,接下来我将一步步教你如何实现这一功能。 1. 准备工作 首先,确保你的R环境中已经安装了ggplot2包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装: ...
书接上回: 无知小白:R语言ggpubr绘制小提琴图(violin plot)1 三图默认一行上文第3部分多图组合分面绘制(长矩阵结构数据)时,若是三个图默认是一排: p <- ggviolin(data1, x = "surstat", # x轴…
- 类似于ggplot2，我们可以直接在图表上显示p值。- 我们也可以移除图例或调整其位置，以便更好地展示我们的数据。4. 组合多个小提琴图：- 首先独立创建每个图表，然后使用`ggarrange()`函数进行组合。- 这允许我们根据需要自定义布局和美化图表。5. 在单一图表中绘制多个小提琴图：- 我们需要将数据转换...
使用R语言的ggpubr包绘制小提琴图（violin plot）的步骤与技巧介绍。1. 使用ggviolin命令绘制单个两分组的小提琴图，可通过添加命令更改配图颜色，选择杂志风格如 "npg"、"aaas" 等。1.1 更改横坐标两个分组的名字，但上方的图例名字无法直接更改。可先在数据中进行修改。1.2 添加p值与ggplot2绘图...