p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
柱状图和箱线图的代码能理解了其实发现好多作图都是可以触类旁通的,小提琴图作为科研结果常用展示图也不可或缺,用ggplot或者vioplot。 生信初学者 2023/03/14 2K0 R语言ggplot2每周一图活动第五周:箱线图、小提琴图 ggplot2imagepng 在之前提到的tidytuesday里没有找到关于箱线图和小提琴图比较好的实例,这周的...
library(ggplot2) # Basic violin plot p <- ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_violin() p # Rotate the violin plot p + coord_flip() # Set trim argument to FALSE ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_violin(trim=FALSE) ...
流程跟前文ggplot2绘制差不多 4.1 先直接绘图: p <- ggviolin(data, x = "Stage", y = "gene39", fill = "Stage", alpha = 1, width = 0.5, ylab="Normalized Expression", xlab="Stage", add = "boxplot", add.params = list(fill = "white", width = 0.1,linetype = 1)) 这里还是以g...
Basic violin plot Building a violin plot with ggplot2 is pretty straightforward thanks to the dedicated geom_violin() function. # Library library(ggplot2) # create a dataset data <- data.frame( name=c( rep("A",500), rep("B",500), rep("B",500), rep("C",20), rep('D', 100...
R语言中使用ggplot2包绘制分组小提琴图(violin plot) 作为一名刚入行的开发者,你可能对R语言中的ggplot2包绘制分组小提琴图感到困惑。不用担心,接下来我将一步步教你如何实现这一功能。 1. 准备工作 首先,确保你的R环境中已经安装了ggplot2包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装: ...
关于plot:R split violinplot ggplot2 R split violinplot ggplot2 我正在尝试用ggplot2制作拆分小提琴情节,就像这样。我找到了一个非常好的代码,但我无法使用它,因为当我尝试创建pdat时它是空的,我不知道为什么会这样。接下来我附上了我的数据摘要和我正在做的事情,以及结果。谁能帮帮我?
Allowed values include ggplot2 official themes: theme_gray(), theme_bw(), theme_minimal(), theme_classic(), theme_void(), ... ... other arguments to be passed to geom_violin, ggpar and facet.Details The plot can be easily customized using the function ggpar(). Read ?ggpar for cha...
未安装“ggplot2”等R包的同学请先通过install.packages("包的名字")自行安装。 Step 1:构造模拟数据 首先我们用runif函数构造了5组模拟数据,每组10个随机数。runif函数可以生成指定范围内的均匀分布随机数。 library(tidyverse) library(ggpubr) library(ggsignif) ...
使用ggplot创建多个堆叠的小提琴图。 rggplot2violin-plot 4 我有一个模型在不同景观上运行,一次同时在两个上运行,一次分别在每个上运行。我想要用小提琴图来绘制结果,但我想要在同一个图中将这两次运行并排而列,并且每个景观都有自己的小提琴(因此是2个堆栈中的4个小提琴)。示例数据: df1 <- data.frame(...