Basic violin plot Building a violin plot with ggplot2 is pretty straightforward thanks to the dedicated geom_violin() function. # Library library(ggplot2) # create a dataset data <- data.frame( name=c( rep("A",500), rep("B",500), rep("B",500), rep("C",20), rep('D', 100...
未安装“ggplot2”等R包的同学请先通过install.packages("包的名字")自行安装。 Step 1:构造模拟数据 首先我们用runif函数构造了5组模拟数据,每组10个随机数。runif函数可以生成指定范围内的均匀分布随机数。 library(tidyverse) library(ggpubr) library(ggsignif) ...
R语言中，ggplot2可以用来绘制直观的小提琴图（violin plot），便于理解数据分布和差异。首先，确保数据中'surstat'列为factor类型，便于分析。1. 单个“两组”图绘制 以gene39为例，可以先尝试默认参数绘制，然后根据需要调整美观，如添加p值。利用ggpubr包可方便地插入p值，并用星号形式表示。 2....
R语言中使用ggplot2包绘制分组小提琴图(violin plot) 作为一名刚入行的开发者,你可能对R语言中的ggplot2包绘制分组小提琴图感到困惑。不用担心,接下来我将一步步教你如何实现这一功能。 1. 准备工作 首先,确保你的R环境中已经安装了ggplot2包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装: ...
A violin plot by group can be created in ggplot passing the numerical (breaks) and the categorical (tension) variable toaesand usinggeom_violin. # install.packages("ggplot2")library(ggplot2)ggplot(warpbreaks,aes(x=tension,y=breaks))+geom_violin() ...
Allowed values include ggplot2 official themes: theme_gray(), theme_bw(), theme_minimal(), theme_classic(), theme_void(), ... ... other arguments to be passed to geom_violin, ggpar and facet.Details The plot can be easily customized using the function ggpar(). Read ?ggpar for cha...
p<-ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39)) # x分组变量,y表达变量 p+geom_violin() #画出violin plot p+geom_violin(aes(fill = surstat)) #按组别填充颜色 violin 1.2 修改参数美化图: P<- ggplot(data, aes(x = surstat, y = gene39, fill=surstat)) + rotate_x_text(angle = ...
流程跟前文ggplot2绘制差不多 4.1 先直接绘图: p <- ggviolin(data, x = "Stage", y = "gene39", fill = "Stage", alpha = 1, width = 0.5, ylab="Normalized Expression", xlab="Stage", add = "boxplot", add.params = list(fill = "white", width = 0.1,linetype = 1)) 这里还是以g...
使用R语言的ggpubr包绘制小提琴图（violin plot）的步骤与技巧介绍。1. 使用ggviolin命令绘制单个两分组的小提琴图，可通过添加命令更改配图颜色，选择杂志风格如 "npg"、"aaas" 等。1.1 更改横坐标两个分组的名字，但上方的图例名字无法直接更改。可先在数据中进行修改。1.2 添加p值与ggplot2绘图...
- 类似于ggplot2，我们可以直接在图表上显示p值。- 我们也可以移除图例或调整其位置，以便更好地展示我们的数据。4. 组合多个小提琴图：- 首先独立创建每个图表，然后使用`ggarrange()`函数进行组合。- 这允许我们根据需要自定义布局和美化图表。5. 在单一图表中绘制多个小提琴图：- 我们需要将数据转换...