3、 limma-voom分析H19高低表达组,鉴定上下调miRNA,TF,gene。 4、 选择符合以下要求(1)H19(↓)——靶miRNA(↑)——靶tf或靶基因(↓);(2)H19(↑)——靶miRNA(↓)——靶tf或靶基因(↑)的三联体进行细胞实验验证。 结果: 1. H19在24种癌症中的表达水平分析 从TCGA中提取24种癌症中lncRNAs、TFs和基因...
miRNA - TF - 基因关键调控网络:研究人员构建了关键调控网络,该网络可阐明关键因子对麻黄碱生物碱、黄酮类、单萜类等 SMs 生物合成的调控作用。不同关键调控基因在 ES 或 ER 中的表达偏好影响终产物积累,导致麻黄茎根代谢物组成差异巨大。 研究结论与讨论部分指出,该研究深入探讨了麻黄茎根差异代谢物的动态生物合...
同时,其自身表达还受到转录因子的调控,致使在人类正常组织和肿瘤细胞系中均存在组织特异性的表达模式,这样便组成miRNA上下游复杂的调控网络,为研究miRNAs在疾病中的关键作用及药物靶点或诊断提供了新思路。 1. miRNA差异表达分析 对于由miRNA芯片或small RNA-seq获得的表达数据,根据研究目的或实验设计,可对多组样本两两...
乳腺癌TF-miRNA-BCCG调控网络 乳腺癌TF-miRNA-BCCG调控网络 研究背景：microRNA Exportin5 •microRNA（简称miRNA)是一类内源的，长度约为21~25nt，与转录后基因沉默相关的非编码小分子RNA。在动物，其主要通过miRNA5’端的2-8nt的种子序列与靶标基因mRNA的3’端非编码区（3’UTR）不完全互补，进而抑制蛋白质...
谢谢楼下的回答,为了得到更准确的答案,补充如下:miRNA能直接降解TF,如形成复合物等? 扫码下载作业帮搜索答疑一搜即得 答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 TF是转录因子,调控转录产物的,可以是mRNA,也是非编码RNA(例如miRNA),也可是其他.miRNA也可以作用于mRNA,影响mRNA的表达.反正,应该是一个调控的网络. 解析...
本研究利用基于基因表达数据库(GEO)的GSE148864数据集确定与心肌缺血再灌注损伤(MIRI)相关的重要微RNA(miRNA),并创建与MIRI相关的miRNA‑转录因子(TF)‑信使核糖核酸(mRNA)调控网络,为进一步分析MIRI的分子调控网络和发病机制提供了依据。 ...
TFmiR是一个整合分析TF、miRNA、target genes间互作的免费的web server,这三者都与疾病发病机制相关。细胞内在运作依赖于一个极其复杂的激活抑制系统的正确运作,其可能受许多方式的扰动。TFmiR有助于从网络的分子层面更好的阐述细胞机制。 TFmiR提供拓扑性质及功能的分析,使得其在生命科学领域中对研究者而言成为可信的系...
大家在做研究的时候也可以借鉴下面这篇文章它就完美的体现了上面提到的三大招作者首先筛选出来lncrnaheih再依次找到了与之相关的18个基因图中绿色的基因是与肿瘤生长和耐药性相关所以作者推测lncrnaheih也与肿瘤生长和耐药性相关 lncRNA,miRNA,TF的研究思路–GCBI学院 调控表达中相关的lncRNA,miRNA,TF应该如何去研究,...
调控网络基于pubmedmeshkegg等数据库将已经有文献报道数据挖掘以及数据库中的基因与基因mirnatflncrna的调控关系进行了整理组成了现有的调控网络 一键获取基因的TF,miRNA、lncRNA及上下游基因调控网络–GCBI学院 在做基因研究的时候,有时是不是苦于寻找其上下游调控基因,TF,miRNA等。数个数据库,N篇文献来回翻,才能辛...
今天想带大家来学习 networkanalyst 这个网站的使用方法,那这个网站可以用来分析TF -gene、 TF 与 miRNA ,gene-miRNA,protein-chemical 等等它们之间的相互作用。 我们还是来先看一下文件里,那这个文件它就是用 networkanalyst分析了 TF -gene以及TF-mRNA,你会发现它这个下面有给到你它的筛选的一个数值是多少。