To download the software, click the 'Releases' tab and download the 'FULL'-labeled version. Note, if you're going to clone the code from github, do it recursively like so: git clone --recursivehttps://github.com/STAR-Fusion/STAR-Fusion.git...
To download the software, click the 'Releases' tab and download the 'FULL'-labeled version. Note, if you're going to clone the code from github, do it recursively like so: git clone --recursive https://github.com/STAR-Fusion/STAR-Fusion.gitAbout...
https://github.com/STAR-Fusion/STAR-Fusion-Tutorial/wiki https://github.com/FusionInspec
STAR是目前主流的RNA-seq比对软件之一,而STAR-fusion就是一款基于STAR比对结果进行融合基因鉴定的软件,该项目的地址如下 https://github.com/STAR-Fusion/STAR-Fusion/wiki 在对应的文献中,将STAR-fusion与其他融合基因分析软件进行了比较 1. 运行时间 从上图可以看出,STAR-fusion的运行时间有明显优势。 2. ROC曲线...
版本错误原因参考:https://github.com/bcbio/bcbio-nextgen/issues/2693 这就可以用 STAR-Fusion 了 3. 下载 CTAT_lib,放在 某个目录下 方法一:下载28G的plug,解压缩后直接用 从https://data.broadinstitute.org/Trinity/CTAT_RESOURCE_LIB/下载
FusionInspector工具其实是一个打包好的流程,中间过程太多,而且大多数是perl代码,就不一一介绍了,其中最后居然是使用create_fusion_report.py这个python代码出报告。如果你没有安装https://github.com/FusionInspector/fusion-reports工具,就会报错: cd~/miniconda3/envs/rna/share/fusion-inspector-2.2.1-0/fusion-repo...
https://go.hyper.ai/LGmkW 开源项目「awesome-ai4s」汇集了百余篇 AI4S 论文解读，并提供海量数据集与工具：https://github.com/hyperai/awesome-ai4s 数据集：立足山东两县，集成使用 Gaofen-1 和 Sentinel-2 卫星数据 该研究设计了全面的评估实验，使用了来自 Gaofen-1 和 Sentinel-2 卫星的数据集，每个...
For more information, visit https://github.com/STAR-Fusion/STAR-Fusion/wiki/installing-star-fusion#data-resources-required. (default: None) Option is required. --output-dir OUTPUT_DIR Path to the directory that will contain all of the generated files. (default: None) Option is required. ...
https://github.com/hyperai/awesome-ai4s 数据集:立足山东两县,集成使用 Gaofen-1 和 Sentinel-2 卫星数据 该研究设计了全面的评估实验,使用了来自 Gaofen-1 和 Sentinel-2 卫星的数据集,每个数据集都覆盖了相同的地理区域。 * 研究...
可以从GitHub上下载STAR-fusion的最新版本: gitclonehttps://github.com/STAR-Fusion/STAR-Fusion.gitcdSTAR-Fusion AI代码助手复制代码 2.3 下载参考基因组和注释文件 STAR-fusion需要参考基因组和注释文件来运行。可以从GENCODE或Ensembl下载这些文件: # 下载参考基因组wgetftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gen...