利用Perl语言环境下的MISA软件(http://pgrc.ipk-gatersleben.de/misa/)搜索苦荞8条染色体序列基因组的SSR位点,设置SSR检索标准:检索重复单元为2、3、4、5、6 bp,重复长度≥12 bp;二核苷酸最小重复次数≥6次(总长度不少于12个碱基),三至六核苷酸最小重复次...
3.1转录组SSR位点数量与分布 利用Trinity拼接从GA3处理下的南方红豆杉转录组中共获得202 361条Unigene,通过鉴定,共获得了12 008个SSR位点,出现频率(SSR数与总Unigene数之比)为5.93%,这些SSR分布在10 894条Unigene中,发生频率(含SSR的Unigene数与总Unigene数之比...
(4)SSR是DNA中的简单重复序列,不同品系小麦同一位点SSR重复次数不同,但可被相同的引物扩增,常被用于基因定位。①A品系与B品系5号染色体上的SSR位点分别用SSR 和21.(12分)小麦是全球广泛种植的农作物之一。 随着土壤盐渍化越SSRB表示。 对(3)中双亲5号染色体的SSR序列扩增后,进行电来越严重,普通小麦产量下降。
国家大豆区域试验品种(系) SSR位点纯合度分析
位点特异性重组(SSR)是生物基因重组的一种机制,也是合成生物学中的重要工具。该过程涉及使用识别和修改活细胞中特定 DNA 序列的酶,因此在使用细胞疗法治疗疾病方面有重要应用。 例如,免疫疗法需要从患者体内提取免疫细胞并对其进行基因改造以对抗癌症等疾病。在这些应用中,重要的是精确控制基因表达的时间,以最大限度地提...
3种烟草基因组SSR位点信息分析和标记开发 万方数据
【目的】评价与陆地棉纤维品质、产量、黄萎病抗性等主要育种性状关联的简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)位点的选择效果,并挖掘优异典型材料。 【方法】在474份陆地棉中,利用双尾t检验在26个关联标记中筛选具有显著选择效果的变异位点,...
利用这些SSR位点可以:(1)构建玉米品种叶绿体DNA‑SSR指纹数据库;(2)玉米样本母系溯源分析;(3)玉米样本正反交鉴定。应用本发明的叶绿体SSR位点,能够在基因组水平上拓展了玉米可用标记位点的范围,为玉米品种、种质资源鉴定,亲缘关系评价,细胞质遗传特性等研究提供了新的思路和方法。 法律状态 法律状态公告日 法律状态...
摘要 目的:基于赤芝全基因组序列开发SSR标记,研究其种质资源遗传多样性,为赤芝种质资源品种鉴定和分子育种提供理论基础。方法:利用60对SSR引物,对26份不同来源的赤芝菌株进行扩增以筛选出具有多态性的位点;采用毛细管电泳对其进行基因分型,...