#Description:NFS Server release 3.2(RTM1)#Release:3.2 #Codename:RTM1 rpm --version # RPM version 4.11.3 注:RPM为Centos系统 下载并解压安装包 wget-c https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/3.1.1/sratoolkit.3.1.1-centos_linux64.tar.gz tar-zxvf sratoolkit.3.1.1-centos_linux64.tar....
首先下载SRA-toolkit的代码包,使用wget lisa@lisa-VirtualBox:~$ wget https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.9.6-1/sratoolkit.2.9.6-1-ubuntu64.tar.gz 得到tar.gz文件后使用tar zvxf命令解压 lisa@lisa-VirtualBox:~$ tar zvxf sratoolkit.2.9.2-ubuntu64.tar.gz 解压后输入~/sratoolkit.2....
1、conda 安装(推荐使用) conda install sra-tools -y 2、传统安装 2.1 在Linux系统(以CentOS为例)下将上述的链接下载到本地 wget --output-document sratoolkit.tar.gz https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz 2.2 解压安装包 tar -vxzf sratoolkit.tar...
# 01. Downloading SRA Toolkit · ncbi/sra-tools Wiki 目前sratool的最新版本只能手动下载 不能sudo安装, 进入网页后 Cloud - apt-get install script - for Debian and Ubuntu - requires sudo permissions # curl安装的比较慢,时间有限不考虑这个 Ubuntu Linux 64 bit architecture - non-sudo tar archive ...
Kernel: Linux3.10.0-123.el7.x86_64 Architecture: x86_64 6、centos和redhed 使用软件一致 因此选择: 7、 [root@PC3 test]#wget https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.11.0/sratoolkit.2.11.0-centos_linux64.tar.gz 8、进度 9、 ...
[root@PC3 sratoolkit.2.11.0-centos_linux64]#cd bin/[root@PC3 bin]# ls abi-dump fasterq-dump-orig.2.11.0pacbio-load srapath-orig.2.11.0test-sra.2.11.0abi-dump.2fastq-dump pacbio-load.2sra-pileup vdb-config abi-dump.2.11.0fastq-dump.2pacbio-load.2.11.0sra-pileup.2vdb-config.2...
cd sratoolkit.2.10.8-centos_linux64 cd bin ./vdb-config --interactive 运行以上命令行,开始进行配置: 用键盘输入f,出现以下界面: 用键盘 enter: 继续enter: 用键盘敲x: 敲enter: 敲enter后,则返回命令行界面: 测试: 可以使用了。 加入环境变量: ...
单细胞测序技术中，Aspera Connect和SRA Toolkit是常用的下载工具，以下是它们的下载和安装方法。Aspera Connect安装 首先，使用wget下载Aspera Connect软件包：wget download.asperasoft.com...然后解压缩下载的文件：tar zxvf aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz 接下来，运行安装脚本：bash ...
cd sratoolkit.2.10.8-centos_linux64 cd bin ./vdb-config --interactive 1. 2. 3. 4. 5. 1. 运行以上命令行,开始进行配置: 用键盘输入f,出现以下界面: 用键盘 enter: 继续enter: 用键盘敲x: 敲enter: 敲enter后,则返回命令行界面: 测试: ...