#Description:NFS Server release 3.2(RTM1)#Release:3.2 #Codename:RTM1 rpm --version # RPM version 4.11.3 注:RPM为Centos系统 下载并解压安装包 wget-c https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/3.1.1/sratoolkit.3.1.1-centos_linux64.tar.gz tar-zxvf sratoolkit.3.1.1-centos_linux64.tar....
1、conda 安装(推荐使用) conda install sra-tools -y 2、传统安装 2.1 在Linux系统(以CentOS为例)下将上述的链接下载到本地 wget --output-document sratoolkit.tar.gz https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-ubuntu64.tar.gz 2.2 解压安装包 tar -vxzf sratoolkit.tar...
找到sra toolkit下载页面 image.png 复制下载链接 image.png 在linux中使用wget命令下载 wget https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.10.8/sratoolkit.2.10.8-ubuntu64.tar.gz 将文件移动至指定文件夹,如/home/sratoolkit mkdir /home/sratoolkit mv sratoolkit.2.10.8-ubuntu64.tar.gz /home/srato...
# 01. Downloading SRA Toolkit · ncbi/sra-tools Wiki 目前sratool的最新版本只能手动下载 不能sudo安装, 进入网页后 Cloud - apt-get install script - for Debian and Ubuntu - requires sudo permissions # curl安装的比较慢,时间有限不考虑这个 Ubuntu Linux 64 bit architecture - non-sudo tar archive ...
Kernel: Linux3.10.0-123.el7.x86_64 Architecture: x86_64 6、centos和redhed 使用软件一致 因此选择: 7、 [root@PC3 test]#wget https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.11.0/sratoolkit.2.11.0-centos_linux64.tar.gz 8、进度 9、 ...
[root@PC3 sratoolkit.2.11.0-centos_linux64]#cd bin/[root@PC3 bin]# ls abi-dump fasterq-dump-orig.2.11.0pacbio-load srapath-orig.2.11.0test-sra.2.11.0abi-dump.2fastq-dump pacbio-load.2sra-pileup vdb-config abi-dump.2.11.0fastq-dump.2pacbio-load.2.11.0sra-pileup.2vdb-config.2...
单细胞测序技术中,Aspera Connect和SRA Toolkit是常用的下载工具,以下是它们的下载和安装方法。Aspera Connect安装 首先,使用wget下载Aspera Connect软件包:wget download.asperasoft.com...然后解压缩下载的文件:tar zxvf aspera-connect-3.7.4.147727-linux-64.tar.gz 接下来,运行安装脚本:bash ...
-istring 输入私钥,安装 aspera 后有在目录 ~/.aspera/connect/etc/ 下有几个私钥,使用 linux 服务器的时候一般使用 asperaweb_id_dsa.openssh 文件作为私钥。 --hoststring ftp的host名,NCBI的为ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov;EBI的为fasp.sra.ebi.ac.uk。
7、sraToolkit安装使用 7、sraToolkit安装使⽤ ⼀. window 1.下载地址:2.下载:数据下载地址:其他地址:⼆ linux 1、下载安装 tar zxf asper-commect-3.6.1.110647-linux.tar.gz sh aspera-connect-2.4.7.37118-linux-64.sh 2、##加⼊路径 echo "alias acsp=/home/sxuan/.aspera/connect/bin/...