Smart-Seq (Switching mechanism at 5' end of the RNA transcript)于2012年发表[3],2013年发表了其改进技术的应用Smart-Seq2[4],2014年Smart-Seq2 protocol发表[5]。Smart-Seq2 对原始的Smart-Seq实验流程进行了多项改进优化,它不再...
Smart-Seq (Switching mechanism at 5' end of the RNA transcript)于2012年发表[3],2013年发表了其改进技术的应用Smart-Seq2[4],2014年Smart-Seq2 protocol发表[5]。Smart-Seq2 对原始的Smart-Seq实验流程进行了多项改进优化,它不再需要纯化步骤,可大大提高产量,最重要的改进是下面两项: · TSO 3'端最后...
基于10X的数据显示出更严重的dropout问题(dropout是scRNA-Seq数据的一大特点,就是很多基因在某些细胞根本就检测不到表达,但是在另外的细胞却检测为高表达。通常认为这个dropout是因为在文库构建的过程中,有部分基因没有被成功的反转录。),尤其是对于表达水平较低的基因。 10X 技术测序数据由于技术特色在mRNA的3’端有...
Smart-Seq (Switching mechanism at 5' end of the RNA transcript)于2012年发表[3],2013年发表了其改进技术的应用Smart-Seq2[4],2014年Smart-Seq2 protocol发表[5]。Smart-Seq2对原始的Smart-Seq实验流程进行了多项改进优化,它不再需要纯化步骤,可大大提高产量,最重要的改进是下面两项: TSO 3'端最后一个...
看了小贝的介绍,您是否感受到SMART-seq单细胞转录组技术的魅力,如果想了解更多,请联系贝瑞基因当地销售或致电010-84409702。 参考文献 [1] Serra L, Chang D Z, Macchietto M, et al. Adapting the smart-seq2 protocol for robust single worm RNA-seq[J]. Bio-protocol, 2018, 8(4). ...
Smart-Seq简介 Smart-Seq (Switching mechanism at 5' end of the RNA transcript)于2012年发表[3],2013年发表了其改进技术的应用Smart-Seq2[4],2014年Smart-Seq2 protocol发表[5]。Smart-Seq2 对原始的Smart-Seq实验流程进行了多项改进优化,它不再需要纯化步骤,可大大提高产量,最重要的改进是下面两项: ...
单细胞转录组:Smart-seq 2还是10x Genomics Chromium? 应用单细胞测序技术研究科学问题越来越普遍,当下应用最火热的是10x Genomics公司的Chromium解决方案(以下简称10X)。但是基于2017年Christoph Ziegenhainet al[1]对6种单细胞转录组技术及2019 Broad研究所的团队对7种单细胞RNA测序方法进行了比较[2],某些特...
那么今天小编再次对Smart-seq 2与10X Genomics Chromium的技术原理和应用进行阐明。 Smart-Seq简介 Smart-Seq (Switching mechanism at 5' end of the RNA transcript)于2012年发表[3],2013年发表了其改进技术的应用Smart-Seq2[4],2014年Smart-Seq2 protocol发表[5]。Smart-Seq2对原始的Smart-Seq实验流程进行了...
Smart-seq是由路德维格癌症研究所的Rickard Sandberg实验室所开发的一套在全转录组范围进行单细胞RNA测序 (scRNA-seq)的方法。Smart-seq因为以全长mRNA建库,所以对转录本的测序覆盖度也有所上升。Smart-seq2是由Picelli等人从Smart-seq中改良而来(Picelli et al., 2013)(Picelli et al., 2014)。本文将从Smart-se...
Smart-seq是由路德维格癌症研究所的Rickard Sandberg实验室所开发的一套在全转录组范围进行单细胞RNA测序 (scRNA-seq)的方法。Smart-seq因为以全长mRNA建库,所以对转录本的测序覆盖度也有所上升。2014年“升级换代”成SMART-seq2后,成为几乎每个单细胞测序公司都使用...