SMART-seq(Switching mechanism at 5’ end of the RNA transcript)是一项具里程碑意义的技术,相比于10x Genomics单细胞转录组测序技术只捕获转录本的 3’ 端序列,SMART-seq技术能够覆盖完整的转录本,从而在表达分析的基础上,进一步实现可变剪切和SNV检测等深入研究,是10x Genomics单细胞转录组技术的有益补充。这项...
Current single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) methods with high cellular throughputs sacrifice full-transcript coverage and often sensitivity. Here we describe Smart-seq3xpress, which miniaturizes and streamlines the Smart-seq3 protocol to substantially reduce reagent use and increase cellular throughpu...
Smart-Seq (Switching mechanism at 5' end of the RNA transcript)于2012年发表[3],2013年发表了其改进技术的应用Smart-Seq2[4],2014年Smart-Seq2 protocol发表[5]。Smart-Seq2对原始的Smart-Seq实验流程进行了多项改进优化,它不再需要纯化步骤,可大大提高产量,最重要的改进是下面两项: TSO 3'端最后一个...
Separated per protocol (Smart-seq2 and Smart-seq3) and experiment (HEK293FT, Mouse Fibroblasts, HCA cells). (d) Mapping statistics for 5’UMI-containing read pairs in Smart-seq3. Percentage of unmapped read pairs, and read pairs that aligned to exonic, intronic and intergenic regions. ...
1. 单细胞分选:Smart-seq2使用流式细胞仪或显微操作进行细胞分选,体积不超过0.5 ul。 2. 细胞裂解:将分离细胞直接转移到细胞裂解液中进行细胞裂解。 3. 反转录( 一链合成 ):使用Oligo(dT) primer 对带有polyA尾的RNA( 主要mRNA )进行...
Smart-Seq简介 Smart-Seq (Switching mechanism at 5' end of the RNA transcript)于2012年发表[3],2013年发表了其改进技术的应用Smart-Seq2[4],2014年Smart-Seq2 protocol发表[5]。Smart-Seq2 对原始的Smart-Seq实验流程进行了多项改进优化,它不再需要纯化步骤,可大大提高产量,最重要的改进是下面两项: ...
1. 单细胞分选:Smart-seq2使用流式细胞仪或显微操作进行细胞分选,体积不超过0.5 ul。 2. 细胞裂解:将分离细胞直接转移到细胞裂解液中进行细胞裂解。 3. 反转录( 一链合成 ):使用Oligo(dT) primer 对带有polyA尾的RNA( 主要mRNA )进行反转录。由于使用了特殊活性反转录酶( Moloney Murine Leukemia Virus )进行...
1.Smart-seq2的优势：a. 如果你需要深入研究单个细胞的转录组，尤其是关注低表达基因、可变剪接和全...
Smart-Seq简介 Smart-Seq (Switching mechanism at 5' end of the RNA transcript)于2012年发表[3],2013年发表了其改进技术的应用Smart-Seq2[4],2014年Smart-Seq2 protocol发表[5]。Smart-Seq2 对原始的Smart-Seq实验流程进行了多项改进优化,它不再需要纯化步骤,可大大提高产量,最重要的改进是下面两项: ...
4]，2014年Smart-Seq2 protocol发表[5]。Smart-Seq2 对原始的Smart-Seq实验流程进行了多项改进优化，...