搬运,这个是详细版的单细胞测序,这个视频详细介绍了单细胞测序和整体的RNA-seq 也就是转录组测序的区别。这个老哥有点印度口音哈哈哈哈, 视频播放量 1685、弹幕量 3、点赞数 57、投硬币枚数 27、收藏人数 167、转发人数 21, 视频作者 爱科研的医学生Vivian, 作者简介 要做
目前,至少有20种以上的单细胞测序技术,并且各个技术之间存在极大的异质性。2020 年4 月,西班牙科学家在 Nature 杂志上发表了一篇论文Benchmarking single-cell RNA-sequencing protocols for cell atlas projects论述了不同的单细胞测序技术的差异,文章比较了13种常用scRNA-seq和单核RNA-seq实验方案。比较分析显示实验方...
就像前面提到的,比如要做IVT原理的高通量单细胞转录组,目前可以用inDrops配合CEL-seq2的建库思路的组合达到更高效。 还是那句话,涉及到的方法比较多,如有纰漏的地方大家及时指出,我们及时修改,大家一起进步! 1. Hedlund E, Deng Q. Single-cell RNA sequencing: Technical advancements and biological applications[...
还有一个原理出镜率不是很高,2013年发表于PNAS的Two methods for full-length RNA sequencing for lowquantities of cells and single cells这里仅给出流程图,这两种方法在反转那一步没有做创新,而是在之后的cDNA放大部分做文章。 从图中可以看到,这里分别用到了Phi29DNA聚合酶和半随机引物来较小偏差地扩增cDNA。...
ingle cell sequencing (taken from Wikipedia) 原理 以Nanoliter Droplets方法为例: Highly Parallel Genome-wide Expression Profiling of Individual Cells Using Nanoliter Droplets overview 首先是组织处理得到单细胞,包裹在单个的microparticle里面,而microparticle里面又存有包含polyT的beads,于是可以结合mRNA反转成为cDNA,...
3、单细胞测序基本原理 这里我们以10X Genomics为例，简述下单细胞测序原理。感兴趣的可以去B站获取更多...
在本周一的文章(复现原文(一):Single-cell RNA sequencing of human kidney(step by step))中,我们完成了scRNA-seq数据的质控(Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三)- 原始数据质控)、批次校正、找Marker基因(单细胞分群后,怎么找到Marker基因定义每一类群?)、UMAP可视化和tSNE可视化(Hemberg-lab单细胞转录组数据分...
题目:Single-cell RNA sequencing ofperipheral blood mononuclear cells from acute Kawasaki disease patients 时间:2021年9月 期刊:Nature communications (IF: 12.298) 链接:https://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.07.009 作者利用单细胞RNA以及BCR/TCR测序对急性KD患者PBMCs进行分析,通过静脉注射免疫球蛋白(IVIG)...