搬运,这个是详细版的单细胞测序,这个视频详细介绍了单细胞测序和整体的RNA-seq 也就是转录组测序的区别。这个老哥有点印度口音哈哈哈哈, 视频播放量 1631、弹幕量 2、点赞数 57、投硬币枚数 27、收藏人数 167、转发人数 21, 视频作者 爱科研的医学生Vivian, 作者简介 要做
3.Tang F , Barbacioru C , Wang Y , et al. mRNA-Seq whole-transcriptome analysis of a single cell.[J]. Nature Methods, 2009, 6(5):377-382. 4.Islam S , Kjallquist U , Moliner A , et al. Characterization of the single-cell transcriptional landscape by highly multiplex RNA-seq[J...
2. Smart-seq:本方案将cDNA打断后,对转录本的所有片段测序,优势是测序灵敏度高(基因检出数比3‘/5’ 转录组测序高)、可以检测转录本的全长片段信息,缺点是细胞通量较低,单个细胞的测序成本较高,而且检测的并不是真实的全长转录本; 3. 单细胞三代转录组测序:在获得单细胞全长cDNA后经过扩增和建库,用Nanopore...
就像前面提到的,比如要做IVT原理的高通量单细胞转录组,目前可以用inDrops配合CEL-seq2的建库思路的组合达到更高效。 还是那句话,涉及到的方法比较多,如有纰漏的地方大家及时指出,我们及时修改,大家一起进步! 1. Hedlund E, Deng Q. Single-cell RNA sequencing: Technical advancements and biological applications[...
Single-cell 工作流程OVERVIEW ingle cell sequencing (taken from Wikipedia) 原理 以Nanoliter Droplets方法为例: Highly Parallel Genome-wide Expression Profiling of Individual Cells Using Nanoliter Droplets overview 首先是组织处理得到单细胞,包裹在单个的microparticle里面,而microparticle里面又存有包含polyT的beads,...
介绍为什么要做单细胞rna测序,以及具体如何做, 视频播放量 120、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 5、转发人数 0, 视频作者 小云爱生信, 作者简介 我司将持续更新生物信息学,相关视频,文章,关注可私信提问哦!,相关视频:单细胞RNAseq 处理与质控,RNAseq数
使用single-cell RNA-seq能够从海量的单细胞数据中揭示组织中不同细胞类型,以及同一细胞中不同基因的表达情况。这篇文章通过单细胞RNA-seq构造了小鼠雄性生殖细胞分化发育的表达动态图谱,揭示了关键调控因子,并且提供了一种分离最后阶段圆形精子的表面标...
2017年发表在Nature Methods杂志上的SCENIC[1]算法,利用单细胞RNA-seq数据,同时进行基因调控网络重建和细胞状态鉴定,应用于肿瘤和小鼠大脑单细胞图谱数据,提出并证明了顺式调控网络分析能够用于指导转录因子和细胞状态的鉴定。SCENIC通过使用生物学驱动的features自动清除肿瘤样本特异性等批次效应。
从这个系列开始，我们将跟着一篇《Cell》文章学习单细胞转录组数据的下游分析，以及下游分析数据的个性化...