在本周一的文章(复现原文(一):Single-cell RNA sequencing of human kidney(step by step))中,我们完成了scRNA-seq数据的质控(Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三)- 原始数据质控)、批次校正、找Marker基因(单细胞分群后,怎么找到Marker基因定义每一类群?)、UMAP可视化和tSNE可视化(Hemberg-lab单细胞转录组数据分...
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Since the first publication a decade ago describing the use of single-cell RNA sequencing (scRNA-...
2、目前单细胞测序类型 单细胞转录组测序：单个细胞转录组水平测序 单细胞核测序：解决无法捕获完整细胞的...
常规的单细胞RNA-seq分析结合常规的空间RNA-seq分析代谢实现1加1大于2:解析乳腺癌早期传播过程中的代谢演变 乳腺癌现在已成为全球最常见的恶性肿瘤,占女性癌症的近30%。由于治疗手段的快… 陈娜 单细胞RNA测序的简单介绍 This is mainly a summary of the article SINCERA: A Pipeline for Single-Cell RNA-Seq ...
单细胞RNA测序Single Cell RNA Sequencing vs. Bulk RNA Sequencing 3876 1 7:35:42 App 生肉|Single cell RNA-seq data analysis with R (2019) 单细胞RNA测序数据分析教程 2万 31 31:32 App 30分钟拿下RNA-seq原理、操作方法、分析方法和应用场景 443 -- 3:15:30 App 单细胞RNA-seq ChiPster 6599...
时间回到2015年,SC3-seq(single cell single-cell mRNA 3-prime end sequencing)由日本京都大学的一个研究组所报道于Nucleic Acids Research,沿用2009年的方法,并列举了一些扩增全长和UMI的局限性来主打富集3端测序。同年,Genome Biology报道了SUPeR-seq(如图),方法使用半随机引物(T引物连接随机引物)来抓取polyA(+)...
1. Hedlund E, Deng Q. Single-cell RNA sequencing: Technical advancements and biological applications[J]. Molecular Aspects of Medicine, 2017, 59:36-46. 2. Sasagawa Y , Nikaido I , Hayashi T , et al. Quartz-Seq: A highly reproducible and sensitive single-cell RNA-Seq reveals non-genetic...
复现原文(一):Single-cell RNA sequencing of human kidney(step by step),Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程(原理、代码和评述))
Chen Z , Zhou L , Liu L , et al. Single-cell RNA sequencing highlights the role of inflammatory cancer-associated fibroblasts in bladder urothelial carcinoma[J]. Nature Communications, 2020, 11(1):5077. 作者:生信阿拉丁 链接:https://www.jianshu.com/p/a09a67e4566b...