批量细胞测序产生了平均读数,遗漏了驱动复杂生物学的关键细节。 单细胞测序让科学家们能够看到每个细胞的独特基因表达模式。这种视野能够更全面地表征组织异质性,揭示对健康和疾病有重大影响的稀有细胞类型。 了解正在改变我们观察生物学方式的方法 The Chromium Advantage ...
Loupe Browser supports the full suite of 10x Genomics single cell and spatial datasets. Explore single cell data Download diverse 10x Genomics datasets with various assays, samples, and species. Browse all Chromium Single Cell datasets Aggregate of ~900k Human Non Small Cell Lung Cancer and Normal...
# "matrix.mtx.gz" 行是探针 ID,列是细胞 ID sce <- Read10X('test1/filtered_feature_bc_matrix/') # min.cells 某一个基因至少在多少个基因中表达 # min.features 某个细胞至少表达多少个基因 sce<- CreateSeuratObject(counts=sce, project = "10X_PBMC", min.cells =3, min.features =150) 计算...
10x Genomics Chromium GEM-X单细胞解决方案,是基于Chromium X系列仪器,将单细胞基因表达(3’)kit升级为Chromium GEM-X Single Cell Gene Expression v4,将单细胞免疫组(5’)kit升级为Chromium GEM-X Single Cell Immune Profiling v3,此次试剂的升级,将大幅提升单细胞检测的性能,助力拓展肿瘤、免疫、发育、疾病等...
在GEM中,探针与mRNA配对结合、连接并延伸。制备测序文库并开展测序(推荐测序数据量至少为10K reads pairs/cell),然后使用10x Genomics的Cell Ranger和Loupe Browser软件工具进行分析。 04 FFPE样本检测,打破仅新鲜样本进行单细胞转录组测序的局限性 过往单细胞转录组测序仅限新鲜样本(单细胞测序)或新鲜冻存样本(单细胞...
BioSciTools单细胞转录组10X-Genomics SingleCell-RNASeq分析mp.weixin.qq.com/s/quZ2bNI6ZUYu8_Gjrua4RQ 亲爱的BioSciTools用户: 高校开学已有些时间,此次BioSciTool更新带来基于10X Genomics测序CellRange输出结果的单细胞常规转录组(SingleCell RNA-Seq)数据分析程序。多个程序主要参考10X Genomics数据格式和Seu...
高校开学已有些时间,此次BioSciTool更新带来基于10X Genomics测序CellRange输出结果的单细胞常规转录组(SingleCell RNA-Seq)数据分析程序。多个程序主要参考10X Genomics数据格式和Seurat数据分析流程,允许用户执行数据QC、细胞过滤、线粒体基因占比统计、Feature过滤、高变Feature鉴定、PCA分析及JackStraw对PCA的选择、细胞UMA...
10x Genomics Single Cell RNA Sequencing利用10x Genomics平台將細胞簡易處理即可上機定序,能夠在組成多樣且複雜的細胞群集(例如血球細胞,腫瘤微環境),有效率深入解析每一顆單細胞內數千個基因表現量,揭露以往多細胞平均下所隱藏的細胞次分群資訊,在單顆細胞解析度下,開闊免疫學、神經科學、幹細胞生物學、癌症生物學...
10X Genomics凝胶微珠设计 所以一个油滴=一个单细胞=一个凝胶微珠=一个RNA-Seq,可以说这就是10X的基本技术原理。 然而市场并不只有一家Single Cell的商业化捕获平台,另外还有BD这个老牌的抗体巨头的Rhapsody平台。这个平台又是依托什么技术,和10X Genomics技术存在什么区别呢?
$10x Genomics(TXG)$虽然被视为潜力股,但目前single-cell技术在生命科学领域的大规模应用尚需时日。 现阶段,single-cell测序主要用于动物细胞。原核生物因单细胞RNA量过低,植物则因细胞壁的存在,导致实验操作难度较大。single-cell技术的增长不仅依赖其自身的技术突破,还需要上游技术如细胞分选技术的创新升级。或许他...