” 10x Genomics公司在2024年推出了10x Genomics Chromium “GEM-X单细胞解决方案”(点击文字直达原文链接),GEM-X技术更是提升稀有转录本,脆弱细胞和低RNA含量细胞的捕获能力,如中性粒细胞的检出率得到大幅提升,从而挖掘中性粒细胞的潜在潜力可能为癌症的诊断和治疗提供新的见解。
Poly(dT):一长段的T(胸腺嘧啶)序列(约30个碱基长度),这段序列可以与mRNA的Poly(A)尾结合进而捕获mRNA,同时作为逆转录的引物,逆转录出cDNA来。 In addition to the poly(dT) primer that enables the production of barcoded, full-length cDNA from poly-adenylated mRNA, the Single Cell 3ʹ v3.1 Gel...
10xChromiumController可以进行基因组的分析,同时可以进行单细胞水平的功能分析。 2、单细胞仪器10xChromiumSingleCellController具有可伸缩的托盘和触屏界面,占用空间小,不超过1平方英尺,却能够高效的将10万到100万次的移液步骤自动化,采用微流控系统,高通量的对样品进行分离并带上序列标签,达到高通量检测的目的。10xChrom...
图2. 心脏三个发育时期,空间基因表达图谱 接着,作者对中期发育6.5周的心脏组织,进一步采用10x Genomics单细胞技术进行研究,获得了3717个单细胞转录谱,过滤后每个细胞获得2900个基因和11000个unique转录本。对获得的数据进行降维分析,根据marker基因,共鉴定出15个细胞群(如图3B所示)。在这15个细胞群中,有已知的心脏细胞...
10X Genomics Single Cell Immune Profiling Solution是一种在单个细胞水平同时对转录组基因表达和适应性免疫受体库进行高通量测序的新技术,为免疫组学研究提供更具扩展性的平台。其基于10X Genomics平台,一次性能够分离500~10000个单细胞,并可以同时获取5’基因表达的数据和TCR/BCR的V(D)J全长序列。是一种高效的同时...
研究利用单细胞测序技术解析了对照组、结肠炎和PIBD各亚型间结肠黏膜免疫及非免疫细胞的异质性,深入挖掘了儿童结肠炎及炎症性肠病的致病机制,同时证实抗血小板药物双嘧达莫可激活cAMP通路,恢复免疫稳态并缓解结肠炎症状,具有良好的临床治疗效果,为儿童结肠炎及炎症性肠病的防治提供了新的见解。
为了测试 scVelo 的速度估计是否允许识别更复杂的种群动力学,分析考虑了来自发育中的小鼠齿状回的 scRNA-seq 实验,该实验包括两个时间点(P12 和 P35),使用基于液滴的 scRNA-seq(10x Genomics Chromium Single 细胞试剂盒 V1)。 最初的出版物旨在阐明发育和成人齿状回神经发生之间的关系。 尽管他们将瞬时中间状态...
10X Genomics单细胞技术 ChromiumTMSingle Cell 3' Solution是基于10X Genomics平台,能够一次性分离、并标记5000–10000个单细胞,并能在单细胞水平进行检测的技术。该方法基于微流控技术(Microfluidics-based approaches),与Smart有相似的分子生物学原理,运用了模板转换技术,但与Smart的细胞捕获和通量不同。droplet-based方...
$10x Genomics(TXG)$虽然被视为潜力股,但目前single-cell技术在生命科学领域的大规模应用尚需时日。 现阶段,single-cell测序主要用于动物细胞。原核生物因单细胞RNA量过低,植物则因细胞壁的存在,导致实验操作难度较大。single-cell技术的增长不仅依赖其自身的技术突破,还需要上游技术如细胞分选技术的创新升级。或许他...
下载:https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/downloads/latest? 定量:https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/pipelines/latest/using/count fastq命名:https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/software/pipelines/latest/using/fastq-...