Poly(dT):一长段的T(胸腺嘧啶)序列(约30个碱基长度),这段序列可以与mRNA的Poly(A)尾结合进而捕获mRNA,同时作为逆转录的引物,逆转录出cDNA来。 In addition to the poly(dT) primer that enables the production of barcoded, full-length cDNA from poly-adenylated mRNA, the Single Cell 3ʹ v3.1 Gel...
” 10x Genomics公司在2024年推出了10x Genomics Chromium “GEM-X单细胞解决方案”(点击文字直达原文链接),GEM-X技术更是提升稀有转录本,脆弱细胞和低RNA含量细胞的捕获能力,如中性粒细胞的检出率得到大幅提升,从而挖掘中性粒细胞的潜在潜力可能为癌症的诊断和治疗提供新的见解。
而基于10x Genomics的Visium空间基因表达解决方案的科研文章也新鲜出炉啦!如果将单细胞技术和空间转录组技术结合起来,想必会得到1+1大于2的效果,这不,2019年在《Cell》上就发表了一篇这样的文章,接下来,就跟随小编一起感受一下10x Genomics单细胞+空间转录组技术组合拳的威力吧! 文献名称:A Spatiotemporal Organ-Wide...
使用10X Genomics ChromiumTM Single Cell Immune Profiling Solution可以捕捉肿瘤发生时,免疫微环境的变化,寻找免疫治疗的靶点,从而辅助免疫治疗更好的抗击肿瘤。应用方向二:探索自身免疫性疾病和炎症性疾病发生机制,辅助疫苗的研究自身免疫性疾病发生起始和发展的中心环节被认为是抗原特异性T细胞激活导致的,使用10X Genomics...
10x Genomics Chromium GEM-X单细胞解决方案,是基于Chromium X系列仪器,将单细胞基因表达(3’)kit升级为Chromium GEM-X Single Cell Gene Expression v4,将单细胞免疫组(5’)kit升级为Chromium GEM-X Single Cell Immune Profiling v3,此次试剂的升级,将大幅提升单细胞检测的性能,助力拓展肿瘤、免疫、发育、疾病等...
作为单细胞测序的一个重要里程碑,10x genomic公司于2016年2月推出10x Chromium Single Cell Gene Expression Solution,此平台整合了仪器、试剂盒和信息学软件,能全面对接illumina测序仪,因此可实现大量大细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况,并通过对复杂细胞群体进行深入细致分析,绘制大...
研究利用单细胞测序技术解析了对照组、结肠炎和PIBD各亚型间结肠黏膜免疫及非免疫细胞的异质性,深入挖掘了儿童结肠炎及炎症性肠病的致病机制,同时证实抗血小板药物双嘧达莫可激活cAMP通路,恢复免疫稳态并缓解结肠炎症状,具有良好的临床治疗效果,为儿童结肠炎及炎症性肠病的防治提供了新的见解。
4.Median UMI count per Cell :每个细胞的中位UMI数 5.Median Genes per Cell：每个细胞检测的基因中...
一个系统,一套工作流程,强大的测序应用 10xGenomics公司推出了新的Chromium™系统。利用上千万独特的DNA序列标记的GEMs,Chromium™系统可揭示重要的基因组信息,进行单细胞测序分析使用。 1、全功能仪器10xChromiumController具有可伸缩的托盘和触屏界面,占用空间极小,不超过1平方英尺,却能够高效的将10万到100万次的...
高校开学已有些时间,此次BioSciTool更新带来基于10X Genomics测序CellRange输出结果的单细胞常规转录组(SingleCell RNA-Seq)数据分析程序。多个程序主要参考10X Genomics数据格式和Seurat数据分析流程,允许用户执行数据QC、细胞过滤、线粒体基因占比统计、Feature过滤、高变Feature鉴定、PCA分析及JackStraw对PCA的选择、细胞UMA...