scRNA-seq是单细胞转录组测序(或单细胞RNA测序)的缩写。 scrna seq是什么意思 scrna seq的基本定义 scRNA-seq,即单细胞转录组测序(Single-cell RNA Sequencing),是一种在单细胞水平上研究基因表达差异的技术。该技术通过测序单个细胞中的RNA转录本,揭示每个细胞独特的基因表达模...
一、普通转录组测序(Bulk RNA-Seq)与单细胞测序(scRNA-Seq) (1)普通转录组测序(Bulk RNA-Seq) 普通转录组测序(Bulk RNA-seq)是提取组织、器官、群细胞的Total RNA进行测序,用于分析组织或细胞总体的RNA组成。该方法旨在揭示整个样本中所有基因的表达水平,而不是单个细胞。 (2)单细胞转录组测序(scRNA-Seq) 单...
前列腺癌的致病机制涉及肿瘤细胞与肿瘤微环境之间的相互作用，将scRNA-seq和ST-seq技术应用于该疾病的研究中，有望在该领域找到新的突破点。近日，贵州大学人民医院朱建国教授团队在Cell Regeneration发表了题为“Application and new findings of scRNA-seq and ST-seq in prostate cancer”的综述文章，总结了scRNA-se...
什么是单细胞 RNA 测序(scRNA-Seq)数据? 单细胞 RNA 测序(single-cell RNA seq,scRNA-Seq)是一种用于分析单个细胞中基因表达水平的技术。即可以在单个细胞的水平上检测 RNA 表达。传统的 RNA 测序( Bulk RNA-Seq)方法只能测量样本整体的表达水平,而不能反映细胞间的异质性。
例如寻因生物开发的SeekOne DD全序列转录组试剂盒,便是scRNAseq的全序列产品,据老赵所知,这是目前市场上唯一一家主打“单细胞”+“全序列”的scRNAseq产品。 scRNAseq全序列突变分析: 突变分析大致分4步,分别是 按照10x常规分析做定量,获取matrix/barcode/feature三个文件。 按照seurat常规分析做cluster/细胞注释,确...
单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一种强大的技术,用于研究细胞的异质性。在某些情况下,为了提高测序的效率或降低成本,可能会采用不同样本或不同物种的单细胞混样上机。以下是混样上机的一些优缺点以及数据拆分时的要点: 混样上机的优点: 成本效益:通过合并多个样本,可以降低每个样本的测序成本。
不同的模式(例如scRNA-seq和scATAC-seq) 整合是一种强大的方法,它利用这些变化最大的共享源来识别条件或数据集之间的共享亚群[Stuart and Bulter et al. (2018)]。整合的目标是确保一个条件/数据集的细胞类型与其他条件/数据集的相同细胞类型对齐(例如,对照组巨噬细胞与实验刺激组的巨噬细胞对齐)。
单细胞 DNBelab C4 技术平台基于高通量单细胞建库系统 DNBelab C4,联合自主研发的 DNBSEQ 超高通量测序系统,可以实现单次测序数据产出规模达百万级细胞,可用于检测 scRNA-seq 及 scATAC-seq,在大幅降低建库成本的同时实现全局性的组织细胞图谱,是当前可以实现高通量、低成本、...
1、进行技术改进后,Smart-seq2利用现成的试剂能生产更高质量的文库,且成本也有所下降,为分析大量细胞提供了可能性。 2、Smart-seq2的方案组分和原理是公开的,让研究人员可以进一步对其进行改良,目前在这个方案基础上涌现了许多单细胞测序的新成果。 它的缺陷是:建库过...
单细胞转录测序(scRNA-seq)是在单细胞水平上分析细胞特异性转录组的高通量测序方法。scRNA-seq 的工作流程包括单细胞捕获、mRNA 逆转录、cDNA 文库制备、高通量测序和数据分析。每种细胞类型都具有独特的转录组,可以呈现为特定的数据矩阵。scRNA-Seq逐渐成为研究细胞间转录组差异性,揭示细胞类型、亚型、状态和发展轨迹...