scrna-seq全称为单细胞RNA测序(Single-Cell RNA Sequencing),是一种在单细胞分辨率下分析基因表达水平的高通量技术。它通过分离单个细胞并检测其RNA组成,揭示细胞间的异质性,广泛应用于发育生物学、疾病机制研究和精准医疗等领域。下文将从技术定义、核心特点、应用场景及意义三个方...
单细胞RNA测序(scRNA-seq)识别组织内的细胞亚群,但不能捕获它们的空间分布,也不能揭示细胞间通讯的局部网络。空间转录组能够对细胞进行定位,却无法准确地在组织中产生深层单细胞分辨率的转录组图谱。成功整合单…
因此,scRNA-Seq数据细胞聚类将面临以下计算挑战:稀疏性、高噪音、高维度。 |常见方法 细胞聚类的目标是根据细胞中各个基因表达模式的相似性(或距离)将一组细胞分组变成大类,使得这些大类成为有数学意义的亚群,这是scRNA-Seq数据挖掘的一个重要步骤和目标。目前有几种不同类型的scRNA-Seq细胞聚类算法,其中常用的方法...
软件名称scRNA-seq 全长转录组数据采集系统 软件简称-版本号V1.0 登记号2025SR0031950分类号- 著作权人上海迅研生物科技有限公司首次发表日期2024-11-06 登记日期2025-01-07 该公司其他软件著作权 序号登记日期软件全称软件简称登记号版本号 12025-01-07ARTR-seq 数据存储备份运维系统-2025SR0031943V1.0 ...
scRNA-seq 测序结果显示,肾脏组织中共获得了 10 个细胞类群,但肾小球细胞类型缺失,此外,其中一个细胞类群主要由人为解离诱导的应激反应基因组成。相比之下,snRNA-seq 捕获了多种在 scRNA-seq 数据集中不存在的肾脏细胞类型,包括肾小球足细胞、系膜细胞和内皮细胞。同时也未检测到应激反应基因。与已发表的 scRNA-se...
研究人员采用 scRNA-seq 技术对成人骨髓和胎儿肝脏造血进行分析研究,发现 HSCs 和多能祖细胞(MPP)的亚群具有协同表达的标记基因;此外,成人骨髓表型 HSPCs 的 scATAC-seq 数据表明表型 MPPs 在染色质可及性方面存在差异。然而 HSCs 潜在的命运决定机制目前仍尚不清楚。
scRNA-seq,全称为单细胞转录组测序技术(Single Cell RNA Sequencing),是一种对单个细胞的基因表达进行检测和分析的方法 2楼2023-12-29 08:44 回复 BAGN 通过该方法可以深入了解每个单独的细胞类型、揭示其功能和调控机制以及发现新的潜在药物靶点等,因此在生物医药领域具有广泛的应用前景 3楼2023-12-29 08:44...
斯坦福大学(Stanford University),全称为小利兰·斯坦福大学,简称“斯坦福”,位于美国加州旧金山湾区南部帕罗奥多市境内,临近高科技园区硅谷,是私立研究型大学,全球大学校长论坛成员,全球大学高研院联盟成员。 斯坦福大学医学院Q博士的实验室有一个令人兴奋的访问学者、博士后研究机会。
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