3.发现新型RNA:随着RNA-Seq技术的发展,越来越多的新型RNA被发现,其中包括长非编码RNA、小RNA等。而RNA-IP技术可以帮助我们鉴定这些新型RNA所相互作用的蛋白质,并进一步研究其功能和调控机制。 4.RNA药物开发:在药物开发领域,RNA-IP可以帮助筛选出与特定RNA相互作用的小分子化合物或抗体等,从而为RNA药物的设计提供重...
本文运用ac4C acRIP-seq测序技术鉴定到肠道病毒EV71基因组的5’ UTR区IRES内存在ac4C修饰,且由宿主乙酰转移酶NAT10催化产生。该ac4C修饰通过增强PCBP2与IRES的结合来增强病毒RNA的翻译,并提高了RNA的稳定性。此外,抑制NAT10或突变ac4C位点抑制了EV71的复制,且ac4c缺陷突变体EV71在小鼠体内表现出致病性降低。该研究突出...
在机制上,通过RNA pull down和RIP实验发现了HAAPIR直接与NAT10相互作用;通过RNA乙酰化测序/acRIP-seq结合RNA-seq筛选出受HAAPIR影响其乙酰化修饰和表达的靶基因TfecmRNA;通过细胞实验及ChIP-seq验证了TFEC可以进一步上调促凋亡因子Bik的积累,调控心肌细胞凋亡的进展。HAAPIR-NAT10-TFEC-BIK信号轴可能是减少缺血性心...
为了研究RNA剪接的潜在变化，敲减PRPF19或USP15进行RNA-seq，分析剪切事件。既往研究表明，CD44变异体6 (CD44v6)的表达在癌症干性中发挥重要作用。敲低USP15或PRPF19显著降低CD44v6水平(图3-g)。沉默USP15或PRPF19可逆转ABHD11-AS1过表达对CD44v6水平的影响(图3f)。表明USP15核定位增加及与PRPF19互作在ABHD11-...
表观生物积极创新,在国际率先推出ac4C免疫共沉淀测序服务(acRIP-seq),全面解析ac4C在转录组的分布及变化,帮助科研人员深入理解RNA乙酰化在生命和疾病中的作用,促进疾病的精准诊断与治疗研究。 项目流程 RNA乙酰化免疫共沉淀 (acetylated RNA Immunoprecipitation,acRIP)基于抗体特异性结合乙酰化修饰的碱基的原理,以RNA...
MeRIP-seq/qPCR CHIP-seq/qPCR RACE 更多>> 组学服务 RNA-seq测序 lncRNA测序 circRNA测序 外泌体转录组测序 组织细胞蛋白组 外泌体蛋白组 更多>> 生物信息学分析 分子互作分析 定制化作图 靶点预测 GSEA分析 测序数据上传 甲基化位点预测 更多>> 公司动态 ...
ac4C乙酰化RNA免疫沉淀测序(acRIP-seq) ac4C RNA乙酰化(N4-acetyicytidine,ac4C),N4位乙酰胞嘧啶,是真核原核生物中保守的化学修饰,早期研究认为ac4C主要存在于tRNA和18S rRNA上。近期研究显示,mRNA上也存在大量的ac4C,该修饰在促进蛋白翻译、影响RNA稳定性和可变剪接、调控基因表达发挥重要作用,是继m6A修饰之后表观...
Confirmation of the transctiptomic data (RNA-seq) by Quantitative Real-time PCR (Q-PCR.Olga A. PostnikovaMaria HultJonathan ShaoAndrea SkantarLev G. Nemchinov
为了系统的探索 lncRNA 是否与 CaMKIIβ 的功能相关,研究人员首先通过 RNA 免疫沉淀测序 (RIP-seq), RIP-qPCR, WB, qPCR, FISH 等方法鉴定出了一种与 CaMKIIβ 的功能相关的 lncRNA 并将其称之为 Carip, 并通过分析显示该 lncRNA 具有与蛋白质相互作用的能力,从而推断 Carip 可能与海马神经元中的 CaMKII...
9月29日,在国际顶级学术期刊《Nature》发表的一项研究中,来自英国威康信托基金会桑格研究所、香港中文大学、上海农科院、上海交通大学、剑桥大学和墨尔本大学等处的研究人员,通过对骨髓(BM)先天淋巴细胞(ILCs)进行单细胞RNA测序(scRNAseq),确定了不同的ILC前体细胞亚群,描述了不同的ILC发育阶段和途径,并发现PD-1可以...