图2 RNA Pull-down实验流程图(Panda et al., 2016)。RNA Pull-down技术实验流程主要包括以下几个步骤:(1)构建含目的基因序列质粒:选择自己感兴趣的基因,根据其序列用同源重组方式或全基因合成构建含目的基因序列质粒;并测序验证序列准确性,并提取含目的基因序列质粒备用;(2)转录模板的获取:T7 RNA聚合...
在摇床上室温摇动10 min,摇动速度为60-70 rpm。水洗涤:弃银染终止液,加入100 ml Milli-Q级纯水或双蒸水,在摇床上室温摇动2-5 min,摇动速度为60-70 rpm。保存:可在Milli-Q级纯水或双蒸水中保存。或采用适当的方式制备成干胶。十、实验结果 10.1 WB预实验验证抗体质量(WB项目-质控1)例如:结果说明...
这一步也很关键,毕竟我们要把RNA变成cDNA才能进行后续的实验。具体操作如下: 配制RT反应液:在冰上进行这个步骤。为了减少误差,建议稍微多配一点反应液,最后再加入RNA样品。 反转录程序:按照37℃,15min;85℃,5sec的程序进行反转录。完成后,把cDNA放在-20℃保存备用。 定量PCR检测 📊 最后一步就是定量PCR检测了...
RNA Pull down技术利用带标签的RNA探针与目标蛋白质进行体外或体内结合,然后通过亲和分离或免疫共沉淀等方法将结合的复合物分离出来,最后对分离出来的复合物进行检测和分析。这种技术可以快速、有效地筛选和鉴定与特定RNA结合的蛋白质,同时也可以检测和分析RNA的结构和功能。二、实验步骤 设计并合成带标签的RNA探针:...
rna pull down 质谱步骤rna pull down RNA pull down实验是一种用于研究RNA与蛋白质相互作用的技术,其步骤通常包括以下几个阶段: 1.构建RNA过表达质粒:需要通过基因合成并经过测序验证来构建RNA过表达质粒。 2.体外转录模板准备:设计含有T7启动子的引物,通过PCR扩增得到转录模板。 3.体外转录:以PCR产物为模板,...
RNA pull down实验的大致流程:1、探针制备 设计并合成含有T7启动子的特异性引物。使用含有目的基因的质粒作为模板进行PCR扩增。利用PCR产物作为模板进行体外转录,获得目的RNA。对目的RNA进行标记,通常使用生物素标记。2、细胞裂解液准备 收集细胞并裂解,制备细胞裂解液。通过离心去除细胞碎片,收集上清液。3、RNA-蛋白...
以下是RNA Pull Down实验的基本流程: 1. 样品准备:首先,我们需要一个含有目标RNA的细胞或组织样本。这个样本可以通过常规的细胞培养或组织裂解方法获取。同时,为了防止RNA降解,所有操作过程需要在RNA酶抑制剂的存在下进行。 2. 生物素标记:目标RNA通常会被生物素标记。这可以通过化学修饰或利用生物素依赖的转录系统来...
RNA pull down:RNA沉淀检测,是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验方法之一。使用体外转录将RNA进行生物素标记,并与细胞蛋白裂解液孵育,形成RNA-蛋白复合物。复合物通过磁珠结合后分离,复合物纯化洗脱后通过Western blot验证检测特性的蛋白。若筛选可能结合的蛋白通过质谱实验进行检测筛选。
RNA pull-down其目的是检测与RNA互作的蛋白。实验过程简单来说就是把感兴趣的RNA进行体外转录,并标记(如生物素标记),再与细胞裂解液共同孵育,形成RNA-蛋白质复合物,然后将分离得到蛋白质,通过WB 或质谱进行验证或鉴定。 1、磁珠准备 (1)取3 µg Biotin标记的RNA,加入适量Structure Buffer,使得RNA形成二级结构。
rna pull down原理与操作步骤 RNA pull down是一种用于研究RNA与蛋白质相互作用的实验技术。该技术允许研究者鉴定和鉴定与特定RNA序列或结构相关的结合蛋白质。 操作步骤: 1. RNA探针设计:选择需要研究的RNA序列或结构,并设计相应的RNA探针。RNA探针通常是通过体外转录的方式合成。 2.探针修饰:将RNA探针修饰上亲和...