本发明公开一种RNA结合蛋白与环状RNA的结合位点预测方法,其方法包括:先以多尺度的方式扩展网络中的浅层特征,再通过在进入递归神经网络之前对特征进行解码来扩展深层特征,然后将经过扩充后的深层和浅层特征进行融合后送入分类网络的全连接层进行分类,最后根据分类结果判断是否为结合位点,实现RNA结合蛋白与环状RNA的结合...
如果楼主不要求特殊参数设置的话,可以直接从miRanda网页下载所有预测miRNA和mRNA配对的列表。http://www.microrna.org/microrna/getDownloads.do RNA沉默用shRNA, RNA干扰使用microRNA,干扰,沉默的区别在哪里? 沉默是和靶RNA结合,形成双链RNA并讲解,干扰是和目标片段共同竞争结合位点 帮我推荐一些文献:关于EJC(外显...
综上,本实施例公开的蛋白质分子中RNA结合位点的预测方法,能综合考虑了结构特征,序列特征,以及邻居特征,能有效的考虑各种可能对预测结果产生影响的因素,并进一步通过mRMR-IFS筛选特征,从而保留主要的影响特征,减少噪声特征对预测准确性的影响,本发明可以显著提高蛋白质RNA结合位点预测的准确性,解决了生物实验成本昂贵和实验...
本发明涉及一种注意力机制预测lncrna的rbp结合位点的方法,其属于生物信息学领域。 背景技术: [0002] rna结合蛋白(rbp)在不同的翻译后阶段与靶rna分子相互作用,包括选择性剪接、mrna稳定、定位、翻译和降解。发现lncrna与蛋白的相互作用,发现rbps的结合位点,有助于了解转录后的调控机制,探索癌症的发病机制及在其他疾...