描述符是用来表示RNA或蛋白质分子特征的数值,它可以用来描述分子的结构、序列、功能等特征。这些描述符可以用来预测RNA-蛋白相互作用。 常用的RNA-蛋白相互作用预测描述符包括RNA结构、蛋白质结构、RNA序列、蛋白质序列、RNA功能、蛋白质功能等。这些描述符可以用来预测RNA-蛋白相互作用。需要注意的是,RNA-蛋白相互作用...
凝胶迁移实验（EMSA）：通过观察蛋白质与双链RNA的结合是否改变RNA的电泳迁移率，来判断它们是否存在相互...
计算预测蛋白质-RNA相互作用 预测蛋白质-RNA相互作用的计算方法主要包括基于物理原理的分子动力学模拟、基于机器学习的序列和结构分析等两个方面。下面将分别介绍这两个方面中的常用方法。 基于物理原理的分子动力学模拟 分子动力学模拟是一种基于牛顿力学的模拟方法,用来模拟分子系统的动力学过程。在预测蛋白质-RNA相互...
清华大学张强锋课题组在Cell Research杂志上,发表了题为“使用人工智能方法基于细胞内RNA结构预测蛋白质-RNA动态相互作用”(Predicting dynamic cellular protein–RNA interactions by deep learning using in vivo RNA structures)的研究长文。该工作首先使用icSHAPE实验解析了七种常用细胞类型的RNA二级结构图谱,并开发人工...
RNA相互作用预测模型蛋白质-RNA相互作用(PRI)与基因表达调控等多种生物过程密切相关.目前一般从实验和计算机预测两方面研究PRI.虽然X射线晶体衍射和核磁共振等实验方法可获得蛋白质-RNA复合物结构,但这些方法具有耗时长与花费高等缺点,并且有些蛋白质-RNA复合物结晶很难获得.特别是,随着高通量测序技术的应用,有大量的...
2021年2月23日,清华大学生命学院张强锋课题组在Cell Research杂志发表了题为 :Predicting dynamic cellular protein–RNA interactions by deep learning using in vivo RNA structures(使用人工智能方法基于细胞内RNA结构预测蛋白质-RNA动态相互作用)的研究长文。
蛋白质和RNA 相互作用的研究为最终探明 RNA 和蛋白质相互作用的分子机制,从本质上认识相关细胞生理过程起着不可忽视的重要作用。 采用实验的方法预测蛋白质和 RNA 的相互作用有很大的局限性,或因实验步骤过多,既耗时又费力,也增加了实验结果的不稳定性。 因此,利用计算的方法预测蛋白质和 RNA 相互作用成为当前的...
预测蛋白质和RNA相互作用的方法研究 引言 蛋白质与RNA的相互作用在许多生理过程中起着重要的作用,RNA参与很多基本的细胞生理过程,如携带来自DNA的遗传信息,参与形成核糖体、拼接体、端粒酶等许多核酸蛋白颗粒的结构,有些RNA还具有酶活性等,几乎所有的RNA生物功能的发挥都需要蛋白质的共同作用。蛋白质和RNA相互作用的...
分类号:学校代号:10150UDC:密级:学号:20132258硕士学位论文蛋白质-RNA相互作用预测方法研究Thepredictionmethodsofprotein-RNAinteractions学生姓名:***师:..