RIP-Seq互作组验证,即在互作组分析筛选的基础上,进一步利用RIP-qPCR技术对感兴趣分子进行靶向检测,更加精细,也是互作组验证的必由之路。成功验证上岸的基础是理想的互作组数据库和丰富的分析经验,方能事半功倍。广州基云生物,在IP互作组检测和关键机制分子筛选验证领域,具有丰富的经验,助力您的互作机制研究。
RIP-qPCR是一种检测细胞内蛋白/RNA互作的靶向验证技术。该技术通过联合免疫共沉淀技术和RT-qPCR检测技术,对目的蛋白在特定细胞/组织内的蛋白/RNA互作关系进行验证,明确蛋白/RNA的相互作用关系。该技术适用于目的蛋白在特定细胞/组织中的蛋白/RNA互作检测验证,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作差异研究。因此,该技术...
RIP-qPCR是一种检测细胞内蛋白/RNA互作的靶向验证技术。该技术通过联合免疫共沉淀技术和RT-qPCR检测技术,对目的蛋白在特定细胞/组织内的蛋白/RNA互作关系进行验证,明确蛋白/RNA的相互作用关系。该技术适用于目的蛋白在特定细胞/组织中的蛋白/RNA互作检测验证,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作差异研究。因此,该技术...
RIP-qPCR技术是一种用于验证细胞内蛋白与RNA相互作用的重要验证手段,尤其适用于探究转录后调控机制和RBP蛋白结合谱的研究。该技术结合免疫共沉淀和RT-qPCR,旨在揭示目的蛋白在不同条件下的互作变化,是研究细胞内调控网络的关键工具。其价值主要体现在两个方面:首先,蛋白与RNA的互作数据对于深入理解转录后...
rip-qpcr计算公式 RIP-qPCR的计算公式是△△Ct法,首先需要设定一个对照组(比如正常组)和实验组(比如处理组),对照组和处理组分别进行RIP实验和qPCR检测。然后通过比较两组的Ct值,可以得出△Ct值,再通过比较处理组和对照组的△Ct值,可以得出△△Ct值。最后通过比较不同样本的△△Ct值,可以得出它们之间的相对表达...
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RIP-Seq检测和RIP-qPCR验证技术价值: (1)蛋白与RNA相互作用数据,是探究转录后调控机制研究的重要内容,体现机制研究的深度,能明显提升临床基础类研究文章的档次。 (2)蛋白与RNA互作组检测,常用于RBP蛋白的结合谱研究,如m6A-RIP-Seq。但理论上蛋白和RNA生物大分子,均有结合调控的可能。因此可用于目的蛋白结合RNA调控...
针对RIP-qPCR(RNA结合蛋白免疫沉淀-实时定量聚合酶链反应)的数据分析,我们可以按照以下步骤进行: 1. 数据预处理 在进行RIP-qPCR数据分析之前,需要对原始数据进行预处理。这通常包括去除无效数据(如Ct值过高或过低的数据点)、归一化处理以及计算内参基因的表达水平等。 python # 示例代码:去除无效数据(假设data为包含...
总的来说,RIP可用于研究活细胞中RNA与蛋白的互作关系,揭示RNA的功能机制以及RBP从中起到的作用,进而参与生理或病理过程。RNA表观遗传学修饰是近年来研究的热门课题,通过RIP结合qPCR(即RIP-qPCR)可研究表遗传修饰酶与RNA之间的关系,并鉴定靶RNA的表观遗传修饰方式以及定量修饰水平,当然也可以通过WB对修饰酶(或...
RIP-Seq检测和RIP-qPCR验证要点: (1)实验设计:尽量进行实验组别设计和生物学重复检测,提高后续验证的阳性率。常规过表达单组(Ab IP vs IgG IP);动态互作组学(实验组vs对照组vs IgG组)。根据目的设计适当的生物学重复。如果后续以RIP-Seq数据进行互作组标准分析,则需要3-4组生物学重复;如果后续以寻找关键互作RNA...