rip-qpcr计算公式 RIP-qPCR的计算公式是△△Ct法,首先需要设定一个对照组(比如正常组)和实验组(比如处理组),对照组和处理组分别进行RIP实验和qPCR检测。然后通过比较两组的Ct值,可以得出△Ct值,再通过比较处理组和对照组的△Ct值,可以得出△△Ct值。最后通过比较不同样本的△△Ct值,可以得出它们之间的相对表达...
ChIP-qPCR 数据需要针对可变性来源进行标准化,包括染色质数量、免疫沉淀的效率(富集效率)和 DNA 回收率。 两种常用的标准化 ChIP-qPCR 数据方法——Percent Input法和富集倍数法(Fold Enrichmen)。与input相关的ChIP-qPCR数据包括ChIP的背景水平和input染色质的标准化。建议ChIP 实验重复,尽可能将结果与背景信号和标准...
我们的input通常为总量的1/10，即稀释了10倍，Log2 (Input Dilution Factor)≈3.3 计算示例：ΔCt=17.55-（14.05-3.3）=6.8 %input=2^（-6.8）*100%= 0.89742059% 2实验结果示例 2.1 Western检测结果 目的蛋白在目的细胞中有表达，条带大小正常，可用于后续实验。2.2 qPCR原始数据及数据处理 ...
根据RIP-QPCR计算公式计算%Input值; 当%Input<1%时,说明没有结合。 结果分析 1、阴性对照组正常,Input组条带清晰可见, 表明PCR扩增引物可用于该指标的检测。 2、样本组无目的条带,表明目的蛋白不可以与该RNA发生结合。 由于RIP实验能够获得的RNA产物较少, 实验过程中对RNA的损耗也较大, 因此IP后的产物经电泳显...
RIP(RNA免疫沉淀)拉出来的RNA理论上没有内参基因,是怎么算出%of input的呢?赞 回复 转发 赞 收藏 只看楼主 昨夜风吹 2021-09-14 20:29:11 我记得sigma 公司有张计算表 赞 回复 这是响亮的茗子 (不要总是向后仰他会让你怅然若失) 2021-09-19 16:44:23 姐妹!给技术打电话哈! 他们讲的很...
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针对RIP-qPCR(RNA结合蛋白免疫沉淀-实时定量聚合酶链反应)的数据分析,我们可以按照以下步骤进行: 1. 数据预处理 在进行RIP-qPCR数据分析之前,需要对原始数据进行预处理。这通常包括去除无效数据(如Ct值过高或过低的数据点)、归一化处理以及计算内参基因的表达水平等。 python # 示例代码:去除无效数据(假设data为包含...
计算示例: ΔCt=17.55-(14.05-3.3)=6.8 %input=2^(-6.8)*100%= 0.89742059% 2实验结果示例 2.1Western检测结果 目的蛋白在目的细胞中有表达,条带大小正常,可用于后续实验。 2.2 qPCR原始数据及数据处理 详见原始数据excel表:RIP-QPCR数据 2.3柱状图
7. **qPCR检测**：- 通过qPCR验证RNA结合的特异性。8. **数据处理**：- 使用ΔΔCt法计算结合效率，计算示例包括输入量的百分比计算。实验结果包括Western检测结果验证目的蛋白表达，qPCR原始数据及处理结果，柱状图展示阳性对照和阴性对照实验，说明目的蛋白能特异性结合靶标RNA。
RIP-qPCR结果主要看富集效率%input,和富集倍数fold enrichment,没有明确的阈值要求,IP组的靶基因富集效率显著高于IgG组即为有效富集。 IP产物中靶标RNA含量低,信号弱,如何优化? 增加细胞量,并充分裂解释放细胞内的RNA-蛋白质复合物。同时,尝试调整抗体用量、磁珠孵育时间,以提高IP效率,或尝试优化RNA提取步骤。