viewport 1200, 900 此外,一般保存的图片都要进行渲染,那么可直接使用ray命令: ray 1200, 900 也可以指定保存图片的格式以及DPI大小等,如输入命令: png my_image.png, 1200, 900, 300, 1 此时,图片保存在工作目录中,文件名为“my_image.png”,并且图片中结构含黑色轮廓线。 通过以上内容,大家已经可以尝试去...
RAY 有一个师姐问我如何ray(就是渲染一下) 官方解释:“ray” creates a ray-traced image of the current frame. This can take some time (up to several minutes, depending on image complexity). 谷歌翻译:“ray”创建当前帧的光线跟踪图像。 这可能需要一些时间(最多几分钟,具体取决于图像复杂程度)。 ...
最后一步做3D渲染,在菜单窗口,或者显示窗口的输入栏,输入 ray 1000,1000。其中ray是命令,1000,1000是表示生成1000x1000像素的图片。可以根据自己需要改变这两个数字。 3D渲染好以后,就可以把图片存下来了。菜单窗口-File-Save Image As-PNG,输入...
>官方解释:“ray” creates a ray-traced image of the current frame. This can take some time (up to several minutes, depending on image complexity). 谷歌翻译:“ray”创建当前帧的光线跟踪图像。这可能需要一些时间(最多几分钟,具体取决于图像复杂程度)。 >直接看成图比较好理解 ###步骤: >命令行操...
光线追踪能制作出最高质量的分子图像。 PyMOL是第一个拥有高速光线追踪器的全功能分子图像程序。 通过ray命令或点击“ Ray” 按钮,可以光线追踪PyMOL内的任意图像。内置的光线追踪器也使组配高质量的动画成为可能。 6、探测静电力学 PyMOL能够利用泊松波尔兹曼方程计算水溶液状态下的静电力学。
设置Ray_trace_mode设置可以修改最终成图的时候的PyMOL的内部渲染蛋白的模式.下面可以查看不同模式的效果 # 普通颜色 set ray_trace_mode, 0 # 普通颜色+黑色线 set ray_trace_mode, 1 # 仅包含黑色线 set ray_trace_mode, 2 # 倍色+黑色线
15.操作对象liep,改变卡通样式(Color—grays-90) 16.设置透明度 17.精简 18.β折叠放上面,α螺旋放下面。命令行输入:ray 1600,1200 19.标记水分子:将三个保留的水分子点上 label-residue identifier 20.如何移动标签 选择atoms 按住ctrl 点住左键拖动 ...
3.保存图片:png filename.png 制作高清图片,制作完成后,输入ray命令,然后保存图片 4.设置label字体大小,label字体的大小默认是14pt: set label_size,20 5.着色:color red,object name 6.cartoon模式:cartoon loop pymol内置了10种cartoon模式,如下图:
b/37/og dihedral - 用于测量二面角 dihedral measure03, a/18/n, a/18/ca, a/18/cb, a/18/cg 5 关于绘图 draw - 绘制一张基于OpenGL的图像 draw 1600,1200 ray - 绘制一张光线追踪的图像，该图像具有比OpenGL更好的照明和阴影 ray 1200, 900 png - 将图片以PNG格式保存 png my_image.png ...
1.2 内置demo介绍打开PyMOL,点击1.1菜单窗口的Wizard菜单,然后点击Demo->Representations 然后在2.3 对象窗口 和 2.4模式窗口之间会出现各种示例:1.Representations2.Cartoon Ribbons3.Roving Detail4.Roving Density5.Transparency6.Ray Tracing7.Sculpting8.Scripted Animation9.Electrostatics10.CGOs11.Molscript/R3D Input12...