Pymol> ray # 优化图像,使图像具有三维的反射及阴影特效 Pymol> png file-name # 图片被保存在PyMOL安装默认的文件夹中
蛋白质以surface显示,周围的残基显示为棍棒,但是ray出来这个表面会有阴影腔体,很暗。 以mesh的形式显示,就好多了!然后周围的残基是line形式,弄细一点。mesh的宽度设为0.3 发布于 2023-07-10 21:38・新加坡 景观设计 建筑图纸 生物化学 赞同添加评论 分享喜欢收藏申请转载 ...
ray - 绘制一张光线追踪的图像，该图像具有比OpenGL更好的照明和阴影 ray 1200, 900 png - 将图片以PNG格式保存 png my_image.png
7. 生成图片 选择右上角的Draw/Ray→调整分辨率(300DPI)→Ray(slow)→保存图片(PNG格式) 注:生成图片时,一般选用Ray(slow)可以更生动地呈现出三维结构的景深、阴影等。但生成速度相对较慢。PS: 创作不易,希望能对大家有些帮助,也请多多关注点赞支持,有问题欢迎一起讨论。
如果想要对绘制好的结果进行渲染导出,只需要点击右上角的Draw/Ray,设置图片的高度、宽度、DPI、背景是否透明,然后选择Ray(slow)即可渲染,渲染后如果可以的话可以直接导出图片。 渲染前化学结构边缘有锯齿状,渲染后可以使图片更平滑。 渲染后有些部位还会有阴影,如果想取消阴影的显示,只需要点击Setting->Rending->Shado...
Ray 如果觉得当前显示窗口里面显示的结构图像已经满足你的要求了,我们就可以将它保存为图片。在这之前我们可以使用ray命令来优化图像,它可以使图像具有三维的反射及阴影特效,直接使用这个命令: Pymol> ray,即可得到图9 图9 对Pymol的介绍在这里要告一段落了,...
在这之前你可以使用ray命令来优化你的图像,它可以使你的图像具有三维的反射及阴影特效: Pymol> rayPymol> pngyour_path/image_name最后就用该命令导出的图片结束这次笔记吧。Pymol命令的语法与目标选择的表达上次介绍一些Pymol的基本命令。现在来具体说说Pymol命令的语法,还有在选择操作目标应该如果表达。个人觉得这...
如果你觉得当前显示窗口里面显示的结构图像已经满足你的要求了,你可以把它保存为图片。在这之前你可以使用ray命令来优化你的图像,它可以使你的图像具有三维的反射及阴影特效: Pymol> ray Pymol> pngyour_path/image_name 最后就用该命令导出的图片结束这次笔记吧。
在PyMOL的命令行中,先使用set命令调整渲染设置,例如关闭阴影、设置渲染分辨率等。 然后,使用png或tiff命令直接导出图片。例如,要导出名为high_res_image.png的图片,分辨率为4000x4000,DPI为300,可以使用以下命令: pymol set ray_shadows, off png high_res_image.png, dpi=300 ray 4000, 4000 注意,ray命令的...
set ray_trace_color, 0x0033ff 此外,还可以设置一些图片的细节,如以下命令可控制阴影显示与否: set ray_shadows, on set ray_shadows, off 还可以设置透视效果(近大远小),通过以下命令控制是否打开透视效果: set orthoscopic, on set orthoscopic, off ...