这里给大家推荐一个云计算网站,其对于pdb文件的处理小工具是免费给公众开放的,在保证了用户友好的按键设置的情况下,功能丝毫不弱于同类型的免费软件。 殷赋云计算工具网站:https://cloud.yinfotek.com/console/ 殷赋云计算的小工具很实用 用这个小工具处理pdb结构就十分简单明了,并且基本可以实现所有的pymol功能。
dash (8) (new in PyMOL 1.8.2) 在命令行窗口输入下面的命令对各种模式进行感受。 .. code-block:: console cartoon loop cartoon tube cartoon puttycartoon helix 模式 在cartoon automaic 模式下 pymol 中内置了3种cartoon helix模式: 默认default模式 Fancy Helices 模式 两端是尖尖 Cylindrical Helices 模式...
VNC(Virtual Network Console)是虚拟网络控制台的缩写。它是一款优秀的远程控制工具软件,由著名的 AT&T 的欧洲研究实验室开发的。VNC 是基于 UNIX 和 Linux 操作系统的开源软件,远程控制能力强大,高效实用,其性能可以和 Windows 和 MAC 中的任何远程控制软件媲美。阿豪运维之路给大家介绍如何在Ubuntu操作系统的云服务器...
于是又发现了一个很不错的开源分子可视软件–PyMOL(下载). 比起yasara,PyMOL运行更迅速,跨平台(mac, win和linux都能用), 虽然yasara的渲染很不错,不过PyMOL也能导出为povray格式进行渲染.Protein explorer太老了,只能运行于firefox2.0以下和IE6, 我的电脑上都没有. PyMOL打开界面分3块,viewer,console和GUI(...
基于分子形状的比对对于虚拟筛选和骨架跃迁都是非常有用的。 RDKit分子形状比对实例: #导入模块,同时载入数据 from rdkit import Chem from rdkit.Chem import AllChem from rdkit import RDConfig from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole fromrdkit.Chem import Draw ...
PyMol "get_extent" command prints the extent of a selection in the console window. If the selection is a single atom, the extent becomes a point representing the location of the atom. PyMol "label" command generates a label on the specified atom using Python string format patterns with ato...
殷赋云计算工具网站:https://cloud.yinfotek.com/console/ 殷赋云计算的小工具很实用 用这个小工具处理pdb结构就十分简单明了,并且基本可以实现所有的pymol功能。可以去除大蛋白复合物的亚基、可以去除溶剂分子与水分子、还可以去除一些可能造成干扰的小分子。 作者:THU-Bimohttps://www.bilibili.com/read/cv1154918...
通过console口访问路由器 : ### [OK] Restricted Rights Legend Use, duplication, or disclosure by the Government is subject to restrictions as set forth in subparagraph (c) of the Commercial Computerpymol绘图笔记 #selection被着色 例如 PyMOL>color white PyMOL>color orange,pept PyMOL>color...
This doesn't print the H-bond pairs to the console output. If you need that, use this script:http://pymolwiki.org/index.php/Get_raw_distancesSee also:http://pymolwiki.org/index.php/DistanceHope that helps. Cheers, Thomas --
> >>> tested it works well, but the console (as in the screen that the GL > >>> window > >>> shows when I press escape) and the main window keep constantly > >>> showing the > >>> message > >>> > >>> WARNING: glDrawBuffer caused GL error ...