select rep cartoon # 选择所有具有卡通表示的原子,常用于蛋白质二级结构的可视化 select color blue # 选择所有颜色为蓝色的原子,通常用于选择那些在当前可视化中设置为蓝色的原子 select cartoon_color blue # 选择所有卡通表示中颜色为蓝色的原子,常用于选择卡通表示中着色为蓝色的部分 select ribbon_color blue # ...
Color by atom type from a scriptThe “util” module contains a number of functions that color the atoms according to type, with different colors for the C atoms. For instance, util.cbay three in a .pml script will color object “three” by atom type, with the carbon atoms in yellow ...
其他命令的帮助信息也可通过同样的方式 获得,比女口 help color、 help select、help show等等。11PyMOL使用入门#PyMOL使用入门label ESCRIPTICN"1 abeV 1 aDel5 one or mare atoms ini a selection by evaluatlng an expression referencing properties for each ar 26、offi,.USASEla&el selection eKprsslon ...
Pymol> colorcolor-name Pymol> colorcolor-name, selection-expression 第一个color虽然只带一个变量"color-name",但其实它包含了第二个默认变量all,所以它的作用是把整个结构变成"color-name"的颜色。 第二个color带两个变量,和第一个的区别就是把默认的目标选择变量all变成了"selection-expression",也就是说...
2002/10/27 RE: [PyMOL] color by partial charge? (electrostatics) DeLano, Warren 2002/10/26 [PyMOL] amber support in CVS PyMOL Viktor Hornak 2002/10/26 [PyMOL] amber support in CVS PyMOL Viktor Hornak 2002/10/24 [PyMOL] Screen problems Mac OS X 10.2.1 Kersey Black 2002/10...
51、label的其他设置:投影模式,可选值0 (无投影),1 (object有投影到label上,但是label本身无投影),2 (object有投影到label , label也有投影),3 (object不投影到label上,label本身有投影):Pymol set label_shadow_mode, 3文字颜色 :Pymol set label_color, color-name, selection标签文字的轮廓的颜色 ,这样...
Pymol> color green, ss l+"" 其中“ss”代表secondary structure,“h”代表Helix,“s”代表Betasheet,l+""代表Loop和所以其他结构。 这3句的作用分别是把所有的Helix变成红色;把所有的Betasheet变成黄色;把所有的Loop以及其他部分变成绿色,于是我们得到: ...
Pymol> color yellow, ss s Pymol> color green, ss l+"" 其中“ss”代表secondary structure,“h”代表Helix,“s”代表Beta sheet,l+""代表Loop和所以其他结构。 这3句的作用分别是把所有的Helix变成红色;把所有的Beta sheet变成黄色;把所有的Loop以及其他部分变成绿色,于是我们得到: ...
PyMOL>color yellow,name c+o+n+ca #在fc和pept中的主链原子都被着为黄色,但是pept的原子仍然是不可见的。 PyMOL>enable pept #pept原子可见了并显示为黄色 通过disable命令可以删除命名选择时出现的粉红点(pink dots): 语法 disable selection-name ...
Messages by Thread Re: [PyMOL] [EXTERNAL] create a 26 bp RNA from a 13 bp system amirhossein taghavi Re: [PyMOL] [EXTERNAL] create a 26 bp RNA from a 13 bp system Xiang-Jun Lu Re: [PyMOL] [EXTERNAL] How to set spectrum color by default in Pymol Mooers, Blaine H.M. (...