1给选择的片段特定的颜色 set_color – 标准颜色的设置 set_color color1, [186,182,217]color – 选定片段上色 color color1，random_selection 2结构叠落与比对 Align - 常常在结构生物学以及虚拟筛选中使用，当对不同的蛋白结构并对其进行比较时，我们就可以使用align比较蛋白结构，查看两者之间的差异，这个结...
接着,使用set_color命令分别为这些颜色指定了RGB值。最后,通过color命令,你将定义的颜色应用到相应的二级结构部分上。文中的RGB数值为:set_color red_alpha, [138, 138, 204]set_color red_beta, [45, 173, 45]set_color red_loops, [233, 233, 233]...
set_color color_name, [r, g, b]在这个命令中，color_name是您要创建的颜色的名称，而[r, g, ...
set_color oxygen, [1.0,0.4,0.4]; set_color nitrogen, [0.5,0.5,1.0]; remove solvent; as spheres; util.cbaw; bg white; set light_count,10; set spec_count,1; set shininess, 10; set specular,0.25; set ambient,0; set direct,0; set reflect,1.5; set ray_shadow_decay_factor, 0.1; s...
cmd.set_color("color_name", [R, G, B]) # RGB颜色值范围为0-1 cmd.color("color_name", "selection") #设置多个原子的颜色 cmd.color("color_name", "selection") ``` 以下是一些常用的颜色名称和对应的RGB值: -红色:red [1, 0, 0] -绿色:green [0, 1, 0] -蓝色:blue [0, 0, 1]...
set ray_shadow_decay_factor, 0.1; set ray_shadow_decay_range, 2; set depth_cue, 0; ray; 下图中,输入“BW”可以获得一张黑白的Cartoon样式: GIF 下图中,我们输入了“colorh2”可以使蛋白结构根据疏水性进行着色: 上面是我们使用“Shortcut”快捷命令包的几个例子,实际上当然功能更多,该快捷命令包提供了...
PyMOL>color red,ss s PyMOL>color green,ss l+’’ 最后三个例子中ss是二级结构的选择符,h表示helix,s表示beta sheet,l+’‘表示loops和非特定结构。对象和选择的on/off PYMOL可同时呈现多个对象。disable和enable命令可以消除对象的显示,但仍能够通过命令控制它的属性。
>labeln.CGandi.230+246,singleresn下面是改进过的图片:是不是看起来好多了,下面是具体的代码,其中关于电子密度图的设置请见下一节:Pymol>selectnear,resi139+229+230+233+246+499+519+520Pymol>ascartoon,proPymol>鼠标操作:显示near的sidechainPymol>set_colorgrey1,224,224,224Pymol>setcartoon_color,...
A：A代表Action，S：S代表Show，H：H代表Hide，L：L代表Label，C：C代表Color。Lights, Camera, ACTION!操作按钮基本上是编辑按钮的变体，您可以通过它执行任何类型的编辑任务。显示 Show按钮包含用于更改蛋白质结构外观和描绘蛋白质结构的其他分子（如有机分子、主链分子、侧链分子、二硫化物和价原子）的选项。蛋白...