In addition to being lightweight and fast, PyMOL creates images of peerless visualization quality, while offering the flexibility of Python-based development and scalability. Bring your biochemistry to life Produce publication quality images Show important interactions, helpful representations, and key labe...
安装的PyMOL有两种来源:一是官网版,二是开源版。 1. 官网版安装 官网:pymol.org/2/ 官网安装,方便快捷,但需要注册,并提供相应费用。或者可以选择试用30天。30天后,一般功能不受影响,但渲染(Ray)后会出现水印,无法生成高质量的图片。 注意:Python与PyMOL的版本需要相互对应匹配 2. 开源版安装 本次下载安装的...
化学家:PyMOL可以用于化学反应的模拟和可视化,帮助化学家更好地理解化学反应的过程和机理。 材料科学家:PyMOL可以用于材料科学中的结构分析和模拟,帮助材料科学家更好地理解材料的性质和性能。 总之,PyMOL软件适合需要进行分子结构和性质研究的科研人员使用。 PyMOL软件的安装步骤如下: 下载PyMOL软件安装包,选择适合自...
先决条件:要学习使用 PyMOL,我们必须从 RCSB PDB 页面下载蛋白质结构,然后将其加载到 PyMOL 中。请按照以下步骤操作。第 1 步 —转到RCSB PDB 页面并在搜索框中键入 6FEY,如下所示。6FEY 是我们感兴趣的蛋白质的 pdb 名称。(Crystal structure of Drosophila neural ectodermal development factor Imp-L2 ...
要对蛋白质口袋进行分析,我们可以借助一款PyMOL的插件--parKVFinder。首先下载parKVFinder最新版本,下载地址如下:https://github.com/LBC-LNBio/parKVFinder-win/releases/ 解压下载好的.zip文件,然后打开终端,输入以下命令将KVFinder_PATH添加至环境变量:setx KVFinder_PATH D:\Software\PyMOL2.6\Plugin\Py...
Pymol是一款操作简单,功能强大的分子以及蛋白的可视化软件,由薛定谔公司研发,科研人员可以从官网申请最新教育版本,同时pymo的开源版(https://github.com/schrodinger/pymol-open-source),可以直接从网站上下载,但是版本较老。所以,根据需求选择版本进行下载。
普通方式直接下载PyMOL 原始下载方式,直接下载PyMOL 一键安装卸载 软件权限管理 升级提示服务 卫士实时防护 流畅安装,防劫持 软件介绍 软件安装 软件图集 下载地址 软件简介 为您推荐:PyMOL三维分子模型软件分子三维结构显示软件 PyMOL是一款功能强大的三维分子模型软件,PyMOL旨在为您提供全面的分子可视化系统。使用其集成...
PyMol的使用 简单的记录一下pymol的使用,就当是今天的笔记了。 首先下载和安装的过程就一笔带过了 首先演示用pymol打开一个.pdb文件 这里我已经本地下载好一个7qbb.pdb的文件 用记事本打开就是如下图所示 点击pymol的file->open 然后在弹出的窗口选择我们要使用的pdb文件...
1)分析对接结构中蛋白间相互作用使用Pymol打开排名第一的相互作用结构。点击右上角C-by chain将两条链(两个蛋白)标上不同的颜色(图6)。点击A-find-polar contacts-between chains展示两个蛋白间的极性相互作用,这里主要是氢键(图7)。 图6 对接结构分析 ...