蛋白质结构数据库(ProreinData Bank，PDB)是1971年创建的国际上最著名、最完整的蛋白质三维结构数据库。另外还有蛋白质分类数据库SCOP和CATH。SCOP是英国医学研究委员会分子生物学实验室和蛋白质工程中心开发的基于Web的蛋白质结构分类、检索和分析系统。CATH是另一个著名的蛋白质分类数据库，由英国伦敦大学开发和维护。
PDB蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,PDB)(rcsb.org/)是美国Brookhaven国家实验室于1971年创建的,由结构生物信息学研究合作组织(Research Collaboratory for Structural Bioinformatics,RCSB)维护。PDB是目前最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)2.5维(以二维的形式表示三维的数据)结构的数据库,是通过X射线单晶衍...
蛋白质数据库是指包括蛋白质信息的数据库。常用的蛋白质数据库有很多，其中Uniprot被认为收录最广泛和注释信息最全面的蛋白质数据库。Uniprot下包括Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD，详见Uniprot_百度百科。其他的蛋白数据库有PDB（Protein Data Bank，简称PDB，开始建立于1971年）等。国内也有些如由上海生物信息技术研究...
国际蛋白质结构数据库PDB 国际蛋白质结构数据库(PDB)全称为Protein Data Bank,是全球最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)2.5维(以二维的形式表示三维的数据)结构的数据库。PDB网址https://www.wwpdb.org/,用户可以经由网络免费访问,是结构生物学研究的重要资源。
PDB即蛋白质数据库,是一个专门收录蛋白质、核酸等生物大分子三维结构的国际数据库。数据库里的结构都是经过X射线、核磁、冷冻电镜等试验技术测得的。本期视频我们将向大家介绍蛋白质数据库PDB的使用方法,教大家如何使用PDB数据库检索蛋白质用于生物信息学研究。, 视频播放
PDB 数据库全称为 Protein Data Bank,是一个专门收录蛋白质、核酸等生物大分子三维结构的国际数据库。在进行CADD相关的研究时比如反向找靶,需要下载许多的蛋白结构,这时就需要批量下载了。 其实在PDB数据库中就提供了批量下载数据的脚本,可在如下链接查看说明:...
蛋白质数据库Protein Data Bank(PDB)是一个包含蛋白质、核酸等生物大分子的结构数据的数据库,网址是http://www.rcsb.org。PDB可以经由网络免费访问,是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威,各个主要的科学杂志、基金组织会要...
PDB数据库的维护由结构生物信息学研究合作组织（ResearchCollaborationforStructuralBioinformatics,RCSB）负责。PDB数据库蛋白结构数据库简介 2.数据来源 通过实验（X射线晶体衍射，核磁共振，电子显微镜方法等）测定的生物大分子的三维结构。主要是蛋白质的三维结构，还包括核酸、糖类、蛋白质与核酸复合物的三维结构。PDB数据...
本视频是在自己工作和学习过程中整理总结的，在分子对接过程中选择合适的蛋白。