蛋白质数据库是指包括蛋白质信息的数据库。常用的蛋白质数据库有很多，其中Uniprot被认为收录最广泛和注释信息最全面的蛋白质数据库。Uniprot下包括Swiss-Prot、TrEMBL和PIR-PSD，详见Uniprot_百度百科。其他的蛋白数据库有PDB（Protein Data Bank，简称PDB，开始建立于1971年）等。国内也有些如由上海生物信息技术研究...
布鲁克海文蛋白质数据库（The BrookHaven Protein Data Bank，PDB）是经实验测定的生物大分子三维结构数据档案，服务于全球科研、教育工作者和学生。其内容包括原子坐标、参考文献、一级和二级结构信息,也包括了晶体结构因数以及NMR实验数据。PDB时事通讯和CDROM每三个月发布一次。PDB概述 ---PDB由美联邦政府代理基金会与...
PDB蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,PDB)(rcsb.org/)是美国Brookhaven国家实验室于1971年创建的,由结构生物信息学研究合作组织(Research Collaboratory for Structural Bioinformatics,RCSB)维护。PDB是目前最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)2.5维(以二维的形式表示三维的数据)结构的数据库,是通过X射线单晶衍...
PDB 数据库全称为 Protein Data Bank,是一个专门收录蛋白质、核酸等生物大分子三维结构的国际数据库。在进行CADD相关的研究时比如反向找靶,需要下载许多的蛋白结构,这时就需要批量下载了。 其实在PDB数据库中就提供了批量下载数据的脚本,可在如下链接查看说明:...
国际蛋白质结构数据库(PDB)全称为Protein Data Bank,是全球最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)2.5维(以二维的形式表示三维的数据)结构的数据库。PDB网址https://www.wwpdb.org/,用户可以经由网络免费访问,是结构生物学研究的重要资源。 1、PDB发展史 ...
PDB即蛋白质数据库,是一个专门收录蛋白质、核酸等生物大分子三维结构的国际数据库。数据库里的结构都是经过X射线、核磁、冷冻电镜等试验技术测得的。本期视频我们将向大家介绍蛋白质数据库PDB的使用方法,教大家如何使用PDB数据库检索蛋白质用于生物信息学研究。, 视频播放
蛋白质数据库Protein Data Bank(PDB)是一个包含蛋白质、核酸等生物大分子的结构数据的数据库,网址是http://www.rcsb.org。PDB可以经由网络免费访问,是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威,各个主要的科学杂志、基金组织会要...
PDB(Protein Data Bank)数据库是一个收集并存储蛋白质结构信息的国际性数据库。它包含了大量蛋白质的三维结构数据,其中包括蛋白质的结合位点信息。通过访问PDB数据库,我们可以获取并分析蛋白结合位点的相关信息。 本文将介绍PDB数据库蛋白结合位点的相关内容,包括PDB数据库的概述、蛋白结合位点的定义和分类、蛋白结合位点...
PDB 正文: 1.简介 1.1 PDB数据库简介 1.2 目的和用途 2.访问PDB数据库 2.1 网页界面 2.2 编程接口 3.数据搜索与筛选 3.1 关键字搜索 3.2 高级搜索 3.3 过滤和排序 4.数据浏览与可视化 4.1 蛋白质结构展示 4.2 结构对比和比对 4.3 可视化工具介绍 5.数据与导出 5.1 单个结构 5.2 批量数据 5.3 数据格式转换...