参考文献 Wang, Z., Xie, L., Ding, G. et al. Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from acute Kawasakidisease patients.Nat Commun12, 5444 (2021). https: //http://doi.org/10.1038/s41467-021-25771-533972311....
文献学习034--[sc]急性川崎病外周血PBMC单细胞测序 1. Study design and single-cell RNA pro!ling of PBMCs. 作者对采集了3例正常对照和7例川崎病患者给予IVIG治疗前后的外周血,提取PBMC进行了单细胞+TCR BCR 测序。质控之后得到84986细胞,before IVIG: 34073, after IVIG: 36225, health: 14688。 注释得到...
1）用无菌稀释液将血样稀释2-4倍；2）在50ml锥底离心管中先加入15-20ml分离液，然后缓慢加入20-30ml...
参考文献 [1] Jovic, Dragomirka et al. “Single-cell RNA sequencing technologies and applications: A brief overview.” Clinical and translational medicine vol. 12,3 (2022): e694. doi:10.1002/ctm2.694 [2] Geirsdottir, Laufey et al. “Cross-Species Single-Cell Analysis Reveals Divergence of ...
Clustering metrics for single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) are used to assess the quality and reliability of the clustering results. These metrics help in evaluating the performance of different clustering algorithms and parameter settings. One commonly...
在单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析中,我们经常会用到Seurat包和SingleR包。Seurat包主要用于质量控制、分析和探索单细胞数据;它可以鉴定和解释来自单细胞转录本测定的异质性来源,并可以整合成多种类型的单细胞数据;它的的功能包括数据导入、数据过滤、数据归一化、特征选择、数据缩放、数据降维、聚类、数据可视化以及差...
在单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析中,我们经常会用到Seurat包和SingleR包。Seurat包主要用于质量控制、分析和探索单细胞数据;它可以鉴定和解释来自单细胞转录本测定的异质性来源,并可以整合成多种类型的单细胞数据;它的的功能包括数据导入、数据过滤、数据归一化、特征选择、数据缩放、数据降维、聚类、数据可视化以及差...
2. Single-cell RNA sequencing reveals the sustained immune cell dysfunction in the pathogenesis of sepsis secondary to bacterial pneumonia 第二篇也是今年的文章,5.731分,做的继发于细菌性肺炎的败血症患者外周血PBMC的单细胞测序。 Fig 1. 常规的图谱展示 ...
值得一提的是这个数据挖掘是韩国人做的哦,标题是:《Immunological link between periodontitis and type 2 diabetes deciphered by single‐cell RNA analysis》 首先是降维聚类分群和分组后看比例变化 如下所示: 看比例变化 然后是各个单细胞亚群在不同分组的各种差异分析和富集分析 ...
值得一提的是这个数据挖掘是韩国人做的哦,标题是:《Immunological link between periodontitis and type 2 diabetes deciphered by single‐cell RNA analysis》 首先是降维聚类分群和分组后看比例变化 如下所示: 看比例变化 然后是各个单细胞亚群在不同分组的各种差异分析和富集分析 ...