p53腫瘤蛋白p53 PDB基於1TUP的渲染:P53與DNA結合[1] 有效結構 PDB 直系同源檢索:PDBe, RCSB PDB查詢代碼列表 1A1U、 1AIE、 1C26、 1DT7、 1GZH、 1H26、 1HS5、 1JSP、 1KZY、 1MA3、 1OLG、 1OLH、 1PES、 1PET、 1SAE、 1SAF、 1SAK、 1SAL、 1TSR、 1TUP、 1UOL、 1XQH、 1YC5...
MK-8242分子具有高MW,高clogp,较高的推荐剂量(2期剂量为每天0.8 g);默克公司最初通过高通量筛选新的骨架分子以期望得到分子量低、剂量也低的HDM2-P53抑制剂。 图2 hit的优化过程及2和HDM2蛋白的共晶 (PDB 7NA1) 通过高通量筛选得到化合物1,这是一个分子...
在p53-DBD/BCL-2#3复合物结构中,p53-DBD分子与p53-DBD(PDB:2OCJ)30的apo结构具有相似的整体结构,RMSD为0.4Å。p53的两个环,连接链S5和S6的环(S5-S6环)和大环L2,插入由BH1-3结构域组成的BCL-2#3的BH3结合口袋中。BCL-2#3的整体结构与BCL-2的apo溶液结构非常相似(PDB:1GJH)26,α3和α4区域以及...
P53肿瘤抑制蛋白 英文标题：p53 Tumor Suppressor 作者：David Goodsell 原著日期：2002-07 译者：李玉明（上海兽医研究所）翻译日期：2014-10-10 原文链接：10.2210/rcsb_pdb/mom_2002_7 关键词：肿瘤抑制蛋白、癌症、转录调节、转录因子、致癌作用 细胞的守护者 我们的细胞会面对许多危险，比如，化学药品，病毒和...
利用RCSB PBD(https://www.rcsb.org/)数据库,检索到Homo sapiens的Skp2晶体结构,选择Skp2(PDB 2C9W)蛋白作为分子对接的晶体结构。利用Maestro软件的Protein Preparation模块对Skp2蛋白晶体结构进行预处理,残基修复、结构校正、氢键优化...
A recent apo-16E6 structure was deposited to the PDB which has an elongated and distorted alpha-helical linker between the N- and C-terminal lobes; however, the publication describing this structure is yet to be released (PDB ID no 7UAJ). The E6AP LXXLL peptide occupies and stabilizes the...
(PDB 1SAE39) each consist of a β-sheet followed by an α-helix of ~5.5 turns, orientated antiparallel (Fig.5a, left panel)40,41. The C-terminal domain of p53β was predicted to consist of the identical β-sheet and a helix of ~1.5 turns (Fig.5a, middle panel). TheTP53β-stop...
a Superposition of the BCL-2 structure in the p53-DBD/BCL-2 complex with the BCL-2 structure in the BCL-2/Bax-BH3 complex (PDB: 2XA0). BCL-2 and p53 in the p53-DBD/BCL-2 complex are colored hot pink and green, respectively. BCL-2 and Bax-BH3 in the BCL-2/Bax-BH3 complex...
Prediction of nsSNPs in the core domain of p53 (PDB: 1TSR) by BongoTammy, M. K. Cheng
右上图显示了pymol生成的p53-dna复合物的三维结构(pdb号:1tup)。mp53结合dna的功能的氨基酸用灰色实心小球展示(r248和r273),mp53维持p53结构的功能的氨基酸用黑色实心小球展示(r175,g245,r249和r282)。c###展示了10个p53半胱氨酸,包括4对半胱氨酸:c176/c182,c238/c242,c135/c141和c275/c277,以及panda...