NR数据库是指非冗余数据库(Non-redundant Database),它主要用于生物信息学和基因组学研究。NR数据库的核心特点是:去除冗余、提供高质量的非冗余数据、提高数据检索效率、支持多种生物信息学分析。去除冗余是NR数据库最显著的特点,通过删除重复的序列信息,确保数据的唯一性和准确性。这不仅减少了数据存储的空间,还提高...
数据库NR是指非冗余(Non-Redundant)数据库。非冗余数据库是指消除了重复数据的数据库,提高了数据存储效率、减少了数据冗余、降低了数据维护成本。一个非冗余数据库通过规范化(Normalization)过程来组织数据,确保每一份数据只存储一次。数据冗余的减少不仅提高了数据库的查询效率,还降低了数据一致性问题的风险。通过规范...
NCBI的nr数据库是指"非冗余蛋白质数据库"(Non-redundant protein database),它是国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)维护的一个重要的生物信息资源。nr数据库是一个包含了已知蛋白质序列的集合,这些蛋白质来自各种不同的物种,包括动物、植物、微生物等。 2. nr数据库的作用是什...
非冗余数据库设计是一种消除数据中的重复或多余信息的过程。具体来说,非冗余数据库具有以下特点: 1、没有重复数据数据少数性:确保每个数据项只出现一次。避免浪费存储:通过消除重复数据,减小存储需求。 2、正规化设计使用范式:通过数据库正规化减少数据冗余。保持一致性和完整性:确保数据的准确性和一致性。 二、非冗...
【数据库】本地NR数据库如何按物种拆分? 1.准备本地数据库文件NR(Non-Redundant Protein Sequence Database)非冗余蛋白库,是所有GenBank+EMBL+DDBJ+PDB中的非冗余蛋白序列。Taxonomy物种分类数据库,包括大于7万余个物种的名字和系谱,这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋 ...
Nr数据库,全称为Non-RedundantProtein Sequence Database,即包含了GenPept、Swissprot、PIR、PDF、PDB以及RefSeq Database中序列的蛋白质数据库。 (1)数据库下载 个人将下载方式分为图形界面下载和命令行方式下载。 需要使用的软件安装: 代码语言:javascript 代码运行次数:0 复制Cloud Studio 代码运行 # blast wget ht...
NR数据库是一个包含已知蛋白质序列的数据库,用于蛋白质序列的比对和注释。当我们对一个新的蛋白质序列进行比对时,比对结果通常包括匹配的已知蛋白质序列的信息以及一些其他相关信息。 首先,比对结果会告诉我们新的蛋白质序列与NR数据库中已知蛋白质序列的相似性程度。这可以通过比对得分和相似性百分比来衡量。比对得分越...
使用blastp检索蛋白的相似性结果,NR数据库不能直接显示蛋白质在基因组中的存在情况。不能追溯蛋白质的物种来源。因此可以检索Identical Protein Group数据库查看蛋白在基因组上的存在情况。 blastp against NR 数据库: Identical Protein Groups 页面: 可以根据Identical Protein Groups 的信息分析蛋白在基因组上的存在情...
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Go数据与NR数据库的结合可以带来多种好处,例如高效的数据处理、实时数据分析、优异的扩展性和更好的容错能力。其中,高效的数据处理尤为重要。Go语言以其出色的并发处理能力著称,能够快速、高效地处理大量数据请求。而NR数据库(如New Relic)则以其强大的数据存储和查询性能见长。将Go语言与NR数据库结合,可以充分发挥两...