数据库NR是指非冗余(Non-Redundant)数据库。非冗余数据库是指消除了重复数据的数据库,提高了数据存储效率、减少了数据冗余、降低了数据维护成本。一个非冗余数据库通过规范化(Normalization)过程来组织数据,确保每一份数据只存储一次。数据冗余的减少不仅提高了数据库的查询效率,还降低了数据一致性问题的风险。通过规范...
NR数据库是指非冗余数据库(Non-redundant Database),它主要用于生物信息学和基因组学研究。NR数据库的核心特点是:去除冗余、提供高质量的非冗余数据、提高数据检索效率、支持多种生物信息学分析。去除冗余是NR数据库最显著的特点,通过删除重复的序列信息,确保数据的唯一性和准确性。这不仅减少了数据存储的空间,还提高...
非冗余数据库设计是一种消除数据中的重复或多余信息的过程。具体来说,非冗余数据库具有以下特点: 1、没有重复数据数据少数性:确保每个数据项只出现一次。避免浪费存储:通过消除重复数据,减小存储需求。 2、正规化设计使用范式:通过数据库正规化减少数据冗余。保持一致性和完整性:确保数据的准确性和一致性。 二、非冗...
NCBI的nr数据库是指"非冗余蛋白质数据库"(Non-redundant protein database),它是国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)维护的一个重要的生物信息资源。nr数据库是一个包含了已知蛋白质序列的集合,这些蛋白质来自各种不同的物种,包括动物、植物、微生物等。 2. nr数据库的作用是什...
科研必备:全面解析NR、Swissport、GO及KEGG功能基因注释数据库, 视频播放量 765、弹幕量 0、点赞数 11、投硬币枚数 2、收藏人数 24、转发人数 0, 视频作者 百迈客生物, 作者简介 关注我们,带你了解更多生物基因信息知识!——基因科技,改变世界!官网:www.biomarker.co
NT(Nucleotide Sequence Database),核酸序列数据库，是NR库的子集。NR和NT库都可以通过NCBI（National ...
NR数据库是一个包含已知蛋白质序列的数据库,用于蛋白质序列的比对和注释。当我们对一个新的蛋白质序列进行比对时,比对结果通常包括匹配的已知蛋白质序列的信息以及一些其他相关信息。 首先,比对结果会告诉我们新的蛋白质序列与NR数据库中已知蛋白质序列的相似性程度。这可以通过比对得分和相似性百分比来衡量。比对得分越...
非冗余数据库(NR)是专门用于存储非重复蛋白序列的数据库，整合了GenBank、EMBL、DDBJ和PDB中的信息。NR库中的每一个编码序列都拥有相应的氨基酸序列和对应蛋白数据库的序列编号，实现核酸和蛋白数据的交叉索引。NR数据库的子集NT专注于核酸序列，可在NCBI（美国国立生物技术信息中心）进行在线BLAST查询或直接...
那么nr数据库到底算是核酸还是蛋白的数据库呢? image.png 从blast官网给出的上面的截图可以看出,nr既在蛋白也在核酸数据中有。因为对于所有已知的或可能的编码序列,nr中的记录都给出了相应的氨基酸序列(通过已知或可能的读码框推断而来),对于很多还给出了在专门蛋白数据库中的序列号。而PDB + SwissProt + PIR +...
1.准备本地数据库文件 NR(Non-Redundant Protein Sequence Database)非冗余蛋白库,是所有GenBank+EMBL+DDBJ+PDB中的非冗余蛋白序列。Taxonomy物种分类数据库,包括大于7万余个物种的名字和系谱,这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋白序列。NR和Taxonomy数据库都是NCBI的子数据库,会提供比较全面的对应关系。在...