1.根据blast+中提供的脚本 update_blastdb.pl 可以查看和下载能够下载的库 update_blastdb.pl --showall image.png 这里我选择了nr库(非冗余的蛋白库)。 2.然后就是下载了,同样也是使用blast+中的update_blastdb.pl 脚本 nohup update_blastdb.pl --decompress nr &> updata.log & 但是出现问题了。。。...
nt为核酸数据库,nr为蛋白质数据库 008、使用命令行下载 a、 [root@PC1 test02]#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/nr.gz[root@PC1 test02]#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/nt.gz b、解压 [root@PC1 test02]#gunzip nr.gz[root@PC1 test02]#gun...
aspera下载nr数据库 ascp -QT -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 1000M -k1-T anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/blast/db/nr.00.tar.gz ./ 002 ascp -QT -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 1000M -k1-T anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/genomes/re...
用blast的update_blastdb下载nr数据库时，nr.00.tar.gz下完后，下载nr.01.tar.gz失败，显示unable ...
答案:NCBI的nr数据库下载中断可能是由于网络不稳定或下载文件过大导致的。您可以尝试使用腾讯云的云加速CDN服务来优化下载速度,或者将大文件分割成多个小文件进行下载。此外,确保您的网络连接稳定也是解决下载中断问题的关键。 问题解释:NCBI(National Center for Biotechnology Information,美国国家生物技术信息中心)提供了许...
一、NCBI的nr数据库数下载总是中断的原因 1、网络连接问题 下载过程中,如果你的网络连接不稳定或遇到中断,下载可能会中断。这可能是由于网络问题、服务器问题或中间设备故障等原因造成的。尝试在网络连接较好的环境下进行下载,或者检查网络连接是否正常。
ascp快速下载NCBI各种数据库种的数据 NR NT 数据库: #wget -c https://ftp.ncbi.nih.gov/pub/taxonomy/taxdump.tar.gz#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/livelists/gi2acc_mapping/gi2acc_lmdb.db.gz#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/livelists/gi2acc_mapping/gi2...
可以试一下我们的鼠小弟平台做nr注释~
一、NCBI的nr数据库数下载总是中断的原因 1、网络连接问题 下载过程中,如果你的网络连接不稳定或遇到中断,下载可能会中断。这可能是由于网络问题、服务器问题或中间设备故障等原因造成的。尝试在网络连接较好的环境下进行下载,或者检查网络连接是否正常。
一、NCBI的nr数据库数下载总是中断的原因 1、网络连接问题 下载过程中,如果你的网络连接不稳定或遇到中断,下载可能会中断。这可能是由于网络问题、服务器问题或中间设备故障等原因造成的。尝试在网络连接较好的环境下进行下载,或者检查网络连接是否正常。 2、下载限制和防火墙 有些网络环境可能设置了下载限制或防...