https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/nr-prot-metadata.json 下面链接中给出了nr数据库的所有压缩包,构建下载文本,即需要将上述链接中的ftp链接放在一个文本中,然后可以在ftp文本每个ftp链接前加上wget指令: 例如 awk'{print "wget -c -nd -r -np -k -L -p -nd -P NR_database " $0}'nr_ftp...
aspera下载nr数据库 ascp -QT -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 1000M -k1-T anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/blast/db/nr.00.tar.gz ./ 002 ascp -QT -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -l 1000M -k1-T anonftp@ftp.ncbi.nlm.nih.gov:/genomes/re...
nt为核酸数据库,nr为蛋白质数据库 008、使用命令行下载 a、 [root@PC1 test02]#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/nr.gz[root@PC1 test02]#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/nt.gz b、解压 [root@PC1 test02]#gunzip nr.gz[root@PC1 test02]#gun...
网络连接不稳定:学校的网络可能存在不稳定的情况,导致下载过程中断。您可以尝试使用其他网络环境,例如家...
一、NCBI的nr数据库数下载总是中断的原因 1、网络连接问题 下载过程中,如果你的网络连接不稳定或遇到中断,下载可能会中断。这可能是由于网络问题、服务器问题或中间设备故障等原因造成的。尝试在网络连接较好的环境下进行下载,或者检查网络连接是否正常。 2、下载限制和防火墙 有些网络环境可能设置了下载限制或防...
用blast的update_blastdb下载nr数据库时,nr.00.tar.gz下完后,下载nr.01.tar.gz失败,显示unable ...
ascp快速下载NCBI各种数据库种的数据 NR NT 数据库: #wget -c https://ftp.ncbi.nih.gov/pub/taxonomy/taxdump.tar.gz#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/livelists/gi2acc_mapping/gi2acc_lmdb.db.gz#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/livelists/gi2acc_mapping/gi2...
”其中一个原因就是原始表格不规范。 不规范表格的典型特点 这个原始表格可能是你自己做出来的,可能是...
可以试一下我们的鼠小弟平台做nr注释~
一、NCBI的nr数据库数下载总是中断的原因 1、网络连接问题 下载过程中,如果你的网络连接不稳定或遇到中断,下载可能会中断。这可能是由于网络问题、服务器问题或中间设备故障等原因造成的。尝试在网络连接较好的环境下进行下载,或者检查网络连接是否正常。