科研必备:全面解析NR、Swissport、GO及KEGG功能基因注释数据库, 视频播放量 506、弹幕量 0、点赞数 9、投硬币枚数 0、收藏人数 18、转发人数 0, 视频作者 百迈客生物, 作者简介 关注我们,带你了解更多生物基因信息知识!——基因科技,改变世界!官网:www.biomarker.com
NR数据库注释是指对NR数据库中的基因序列进行功能注释和特征预测的过程。NR数据库是NCBI(National Center for Biotechnology Information,国家生物技术信息中心)维护的一个非冗余的蛋白质序列数据库,其中包含了来自不同物种的已知蛋白质序列。注释是将这些蛋白质序列与已知功能的蛋白质进行比对和分析,从而预测其功能和特征。
01非冗余蛋白质序列数据库(Non-Redundant Protein Sequence Database, NR)注释NR数据库是美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI）维护的一个用于存储和提供蛋白质序列信息的数据库。它包括了GenBank基因的蛋白编码序列，PDB（Protein Data Bank）蛋白数据库、SwissProt蛋白序列以及来...
火山引擎是字节跳动旗下的云服务平台,将字节跳动快速发展过程中积累的增长方法、技术能力和应用工具开放给外部企业,提供云基础、视频与内容分发、数智平台VeDI、人工智能、开发与运维等服务,帮助企业在数字化升级中实现持续增长。本页核心内容:nr数据库注释统计图
NR数据库作为NCBI主要数据库之一，库容较大，能注释到较多的基因，但注释到的基因中未验证的信息也较多...
nr数据库注释得到的物种信息怎么有种有属 NR数据库中包含的序列来自不同的生物种类,因此在注释过程中可能会出现物种信息中包含种和属的情况。在分类学中,生物学上的组织结构被分为七个级别,分别是:物种、属、科、目、纲、门和界。种是分类学中最小的分类单位,属则是位
1. Nr/Nt数据库: wget -c ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/nr.gz wget -c ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/nt.gz 具体拆分(按NCBI种类划分进行拆分,可以有效提高比对速率)构建、索引请参考本人其它文章 2. GO数据库: ...
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NR数据库是一个包含已知蛋白质序列的数据库,用于蛋白质序列的比对和注释。当我们对一个新的蛋白质序列进行比对时,比对结果通常包括匹配的已知蛋白质序列的信息以及一些其他相关信息。 首先,比对结果会告诉我们新的蛋白质序列与NR数据库中已知蛋白质序列的相似性程度。这可以通过比对得分和相似性百分比来衡量。比对得分越...
1. 从Mapped Reads出发，使用StringTie软件进行基因拼接，寻找并注释新转录本和新基因，以扩展原有基因组注释。2. **数据库下载与构建**：- Nr/Nt数据库：按种类拆分构建索引，具体步骤参考其他文章。- GO数据库：访问官网下载，详细说明见Blast2go文章。- KEGG：分为介绍和下载两部分，涉及代谢通路...