有没有参考文献,已知一段蛋白质序列,通过NCBI 的blastn,通过搜索结果怎么看该序列别人有没有表达过,或者说有没有参考文献,已知一段蛋白质序列,通过NCBI 的blastn,通过搜索结果怎么看该序列别人有没有表达过,或者说有没有参考文献,
blastn 是用DNA序列去检索其匹配序列时的选项,告诉程序你的序列是核酸序列,你希望检索核酸库,是最常用的一种检索方式。balstp是用蛋白序列去检索时的选项。blastx是你希望数据库把你提交的序列去同时检索DNA库和蛋白库。tblastn是你提交的是DNA序列,你希望程序自动将其翻译后去检索相匹配的蛋白序列。
1. 打开NCBI网站,选择“blast”链接。2. 在“blast”页面上,选择“Nucleotide BLAST”选项。3. 在“Enter query”框中,粘贴ACOS5基因的序列或输入该基因的序列号(例如:ACOS5基因的序列可在GenBank或其他数据库中获得)。4. 在“Database”框中,选择“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”或“N...
blastn 是用DNA序列去检索其匹配序列时的选项,告诉程序你的序列是核酸序列,你希望检索核酸库,是最常用的一种检索方式。 balstp是用蛋白序列去检索时的选项。blastx是你希望数据库把你提交的序列去同时检索DNA库和蛋白库。tblastn是你提交的是DNA序列,你希望程序自动将其翻译后去检索相匹配的蛋白序列。所以,选择什么...
百度试题 题目NCBI BLAST工具只能进行核苷酸序列比对(blastn)和蛋白质序列比对(blastp)。 A.错B.对相关知识点: 试题来源: 解析 A 反馈 收藏
liouwzh 当然可以了,http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi这个网址就可以了。 Virginiaの Originally posted by liouwzh at 2011-05-03 12:21:43: 当然可以了,http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi这个网址就可以了。 介个,不是NCBI的网站么?最近也要做序列比对,以前没弄过,关注一下,猜...
同意楼上的,刚刚测试了下。在organism处限定物种即可:Klebsiella pneumoniae。然后你只需页面搜索就能定位到你的序列。若不限定物种,因为高度同源的序列很多,或者说符合输出条件的数量超过了NCBI反馈序列数量最大值(100条最优结果),多出的序列就被舍弃了,而你的目的序列恰在100以后。我...
你进了NCBI的blast页面之后,粘贴进去序列,下面的program selection 选择第三个。结果中有一个“Gallus gallus”,即是家鸡了(应该是从上面数第二个结果)。
G-BLASTN is a GPU-accelerated nucleotide alignment tool based on the widely used NCBI-BLAST. G-BLASTN can produce exactly the same results as NCBI-BLAST, and it also has very similar user commands. It also supports a pipeline mode, which can fully utilize the GPU and CPU resources when ...
BLASTn results of sequenced PCR fragments versus NCBI nucleotide collection (nr/nt) and NCBI candidate gene reference EST.Steve, BabbenDragan, PerovicMichael, KochFrank, Ordon