也可以直接打开链接。 【BLAST链接】https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 根据自己的序列类型选择相应模块,一般选择Nucleotide BLAST. 输入检索号或FASTA序列,选择物种(根据自己的序列来源来选择,常用的是house mouse或者human),然后直接点击左下角“BLAST” 结果图,主要...
1. 打开NCBI网站，选择“blast”链接。2. 在“blast”页面上，选择“Nucleotide BLAST”选项。3. 在“Enter query”框中，粘贴ACOS5基因的序列或输入该基因的序列号（例如：ACOS5基因的序列可在GenBank或其他数据库中获得）。4. 在“Database”框中，选择“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”或“N...
深入理解:由于blast是区段比对,对于给定的两个序列,blast会把具有相识性的片段(hit)找出来,显示的是hit的信息,所以要判断两个序列的相似性,不但要看比对上的片段(hit)的得分,还要看hit覆盖你输入序列的范围,正因为此,这部分图形显示部分就像整个报告的鸟瞰图一样,hit在你输入序列上的分布。本例是一个较短的蛋白...
NCBI Blast : Nucleotide Sequence ( 1173 letters )Blast, NcbiResults, Formatting
NCBI拥有多个数据库,主要包括GenBank、PubMed、BLAST、Protein、Nucleotide、Gene、OMIM、GEO等。每个数据库的功能都各具特色,共同为生物医学研究提供了强大的支持和数据资源。 GenBank数据库是一个庞大的公共遗传序列数据库,用户可以搜索、下载和分析各类生物的遗传序列数据。例如,科研人员可以在这里查找某个物种的基因序...
blastn 是用DNA序列去检索其匹配序列时的选项，告诉程序你的序列是核酸序列，你希望检索核酸库，是最常用的一种检索方式。balstp是用蛋白序列去检索时的选项。blastx是你希望数据库把你提交的序列去同时检索DNA库和蛋白库。tblastn是你提交的是DNA序列，你希望程序自动将其翻译后去检索相匹配的蛋白序列。
BLAST是一种碱基局部对准检索工具,实质上是一种序列类似性检索工具,它运行 blastp 、blastn、blastx、tblastn、 tblastx 等五种程序的启发式检索算法;这五种程序是利用改进的Karlin和Altschul的统计学方法来描述检索结果的显著性。这些程序不支持主题形式检索,也就是不支持主题词、自由词、文本词等检索。
同意楼上的，刚刚测试了下。在organism处限定物种即可:Klebsiella pneumoniae。然后你只需页面搜索就能定位到你的序列。若不限定物种，因为高度同源的序列很多，或者说符合输出条件的数量超过了NCBI反馈序列数量最大值（100条最优结果），多出的序列就被舍弃了，而你的目的序列恰在100以后。我...
有没有参考文献，已知一段蛋白质序列，通过NCBI 的blastn，通过搜索结果怎么看该序列别人有没有表达过，或者说有没有参考文献，已知一段蛋白质序列，通过NCBI 的blastn，通过搜索结果怎么看该序列别人有没有表达过，或者说有没有参考文献，
When BLAST software is used to compare amino acids or DNA sequences with other amino acids or DNA sequences in libraries, similarity searches involve library links to protei 34、n libraries or nucleotide libraries. The link between libraries occurs in the nucleotide database and is linked to ...